Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TTF2Q9UNY4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TTF2Q9UNY4 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TTF2Q9UNY4 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TTF2Q9UNY4 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TTF2Q9UNY4 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TTF2Q9UNY4 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TTF2Q9UNY4 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TTF2Q9UNY4 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TTF2Q9UNY4 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TTF2Q9UNY4 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TTF2Q9UNY4 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TTF2Q9UNY4 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TTF2Q9UNY4 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TTF2Q9UNY4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TTF2Q9UNY4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TTF2Q9UNY4 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TTF2Q9UNY4 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TTF2Q9UNY4 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TTF2Q9UNY4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TTF2Q9UNY4 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TTF2Q9UNY4 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TTF2Q9UNY4 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TTF2Q9UNY4 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TTF2Q9UNY4 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TTF2Q9UNY4 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TTF2Q9UNY4 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TTF2Q9UNY4 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TTF2Q9UNY4 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TTF2Q9UNY4 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TTF2Q9UNY4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TTF2Q9UNY4 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TTF2Q9UNY4 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TTF2Q9UNY4 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TTF2Q9UNY4 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TTF2Q9UNY4 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TTF2Q9UNY4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TTF2Q9UNY4 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TTF2Q9UNY4 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TTF2Q9UNY4 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TTF2Q9UNY4 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TTF2Q9UNY4 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TTF2Q9UNY4 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TTF2Q9UNY4 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TTF2Q9UNY4 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TTF2Q9UNY4 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TTF2Q9UNY4 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TTF2Q9UNY4 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TTF2Q9UNY4 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TTF2Q9UNY4 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TTF2Q9UNY4 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TTF2Q9UNY4 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TTF2Q9UNY4 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TTF2Q9UNY4 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TTF2Q9UNY4 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TTF2Q9UNY4 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TTF2Q9UNY4 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TTF2Q9UNY4 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TTF2Q9UNY4 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TTF2Q9UNY4 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TTF2Q9UNY4 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TTF2Q9UNY4 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TTF2Q9UNY4 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TTF2Q9UNY4 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TTF2Q9UNY4 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TTF2Q9UNY4 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TTF2Q9UNY4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TTF2Q9UNY4 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TTF2Q9UNY4 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TTF2Q9UNY4 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TTF2Q9UNY4 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TTF2Q9UNY4 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TTF2Q9UNY4 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TTF2Q9UNY4 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TTF2Q9UNY4 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TTF2Q9UNY4 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TTF2Q9UNY4 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TTF2Q9UNY4 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TTF2Q9UNY4 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TTF2Q9UNY4 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TTF2Q9UNY4 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TTF2Q9UNY4 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TTF2Q9UNY4 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TTF2Q9UNY4 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TTF2Q9UNY4 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TTF2Q9UNY4 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TTF2Q9UNY4 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TTF2Q9UNY4 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TTF2Q9UNY4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TTF2Q9UNY4 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TTF2Q9UNY4 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TTF2Q9UNY4 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TTF2Q9UNY4 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TTF2Q9UNY4 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TTF2Q9UNY4 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TTF2Q9UNY4 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TTF2Q9UNY4 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TTF2Q9UNY4 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TTF2Q9UNY4 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TTF2Q9UNY4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms