Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNFSF18Q9UNG2 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNFSF18Q9UNG2 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNFSF18Q9UNG2 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNFSF18Q9UNG2 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNFSF18Q9UNG2 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNFSF18Q9UNG2 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNFSF18Q9UNG2 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNFSF18Q9UNG2 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNFSF18Q9UNG2 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNFSF18Q9UNG2 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNFSF18Q9UNG2 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNFSF18Q9UNG2 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNFSF18Q9UNG2 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNFSF18Q9UNG2 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNFSF18Q9UNG2 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNFSF18Q9UNG2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNFSF18Q9UNG2 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNFSF18Q9UNG2 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNFSF18Q9UNG2 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNFSF18Q9UNG2 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNFSF18Q9UNG2 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNFSF18Q9UNG2 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNFSF18Q9UNG2 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNFSF18Q9UNG2 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TNFSF18Q9UNG2 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNFSF18Q9UNG2 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNFSF18Q9UNG2 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TNFSF18Q9UNG2 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNFSF18Q9UNG2 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TNFSF18Q9UNG2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
TNFSF18Q9UNG2 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNFSF18Q9UNG2 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNFSF18Q9UNG2 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNFSF18Q9UNG2 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TNFSF18Q9UNG2 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNFSF18Q9UNG2 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNFSF18Q9UNG2 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNFSF18Q9UNG2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TNFSF18Q9UNG2 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TNFSF18Q9UNG2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNFSF18Q9UNG2 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TNFSF18Q9UNG2 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TNFSF18Q9UNG2 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TNFSF18Q9UNG2 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFSF18Q9UNG2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFSF18Q9UNG2 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFSF18Q9UNG2 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFSF18Q9UNG2 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFSF18Q9UNG2 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFSF18Q9UNG2 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFSF18Q9UNG2 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFSF18Q9UNG2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFSF18Q9UNG2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFSF18Q9UNG2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFSF18Q9UNG2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFSF18Q9UNG2 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFSF18Q9UNG2 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFSF18Q9UNG2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFSF18Q9UNG2 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFSF18Q9UNG2 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFSF18Q9UNG2 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFSF18Q9UNG2 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFSF18Q9UNG2 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFSF18Q9UNG2 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFSF18Q9UNG2 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFSF18Q9UNG2 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFSF18Q9UNG2 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFSF18Q9UNG2 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFSF18Q9UNG2 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFSF18Q9UNG2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFSF18Q9UNG2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFSF18Q9UNG2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFSF18Q9UNG2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFSF18Q9UNG2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFSF18Q9UNG2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFSF18Q9UNG2 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFSF18Q9UNG2 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFSF18Q9UNG2 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFSF18Q9UNG2 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFSF18Q9UNG2 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFSF18Q9UNG2 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFSF18Q9UNG2 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFSF18Q9UNG2 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFSF18Q9UNG2 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFSF18Q9UNG2 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFSF18Q9UNG2 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFSF18Q9UNG2 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFSF18Q9UNG2 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFSF18Q9UNG2 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFSF18Q9UNG2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFSF18Q9UNG2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFSF18Q9UNG2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFSF18Q9UNG2 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFSF18Q9UNG2 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFSF18Q9UNG2 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFSF18Q9UNG2 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFSF18Q9UNG2 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFSF18Q9UNG2 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFSF18Q9UNG2 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms