Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE3

DENND2A, DENN domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND2AQ9ULE3 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DENND2AQ9ULE3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DENND2AQ9ULE3 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DENND2AQ9ULE3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DENND2AQ9ULE3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DENND2AQ9ULE3 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DENND2AQ9ULE3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DENND2AQ9ULE3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DENND2AQ9ULE3 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
DENND2AQ9ULE3 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DENND2AQ9ULE3 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DENND2AQ9ULE3 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DENND2AQ9ULE3 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DENND2AQ9ULE3 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DENND2AQ9ULE3 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DENND2AQ9ULE3 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DENND2AQ9ULE3 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DENND2AQ9ULE3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DENND2AQ9ULE3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DENND2AQ9ULE3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DENND2AQ9ULE3 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DENND2AQ9ULE3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DENND2AQ9ULE3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DENND2AQ9ULE3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DENND2AQ9ULE3 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DENND2AQ9ULE3 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DENND2AQ9ULE3 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DENND2AQ9ULE3 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DENND2AQ9ULE3 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DENND2AQ9ULE3 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DENND2AQ9ULE3 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DENND2AQ9ULE3 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DENND2AQ9ULE3 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DENND2AQ9ULE3 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
DENND2AQ9ULE3 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DENND2AQ9ULE3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DENND2AQ9ULE3 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DENND2AQ9ULE3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DENND2AQ9ULE3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DENND2AQ9ULE3 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DENND2AQ9ULE3 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
DENND2AQ9ULE3 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DENND2AQ9ULE3 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DENND2AQ9ULE3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DENND2AQ9ULE3 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DENND2AQ9ULE3 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DENND2AQ9ULE3 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DENND2AQ9ULE3 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DENND2AQ9ULE3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DENND2AQ9ULE3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DENND2AQ9ULE3 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DENND2AQ9ULE3 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DENND2AQ9ULE3 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DENND2AQ9ULE3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DENND2AQ9ULE3 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DENND2AQ9ULE3 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DENND2AQ9ULE3 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DENND2AQ9ULE3 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
DENND2AQ9ULE3 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DENND2AQ9ULE3 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
DENND2AQ9ULE3 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
DENND2AQ9ULE3 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DENND2AQ9ULE3 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DENND2AQ9ULE3 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DENND2AQ9ULE3 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DENND2AQ9ULE3 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DENND2AQ9ULE3 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DENND2AQ9ULE3 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DENND2AQ9ULE3 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DENND2AQ9ULE3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DENND2AQ9ULE3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DENND2AQ9ULE3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DENND2AQ9ULE3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DENND2AQ9ULE3 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DENND2AQ9ULE3 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DENND2AQ9ULE3 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DENND2AQ9ULE3 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DENND2AQ9ULE3 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DENND2AQ9ULE3 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DENND2AQ9ULE3 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DENND2AQ9ULE3 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DENND2AQ9ULE3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
DENND2AQ9ULE3 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DENND2AQ9ULE3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DENND2AQ9ULE3 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DENND2AQ9ULE3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
DENND2AQ9ULE3 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DENND2AQ9ULE3 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DENND2AQ9ULE3 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DENND2AQ9ULE3 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
DENND2AQ9ULE3 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DENND2AQ9ULE3 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DENND2AQ9ULE3 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DENND2AQ9ULE3 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
DENND2AQ9ULE3 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DENND2AQ9ULE3 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
DENND2AQ9ULE3 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DENND2AQ9ULE3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DENND2AQ9ULE3 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DENND2AQ9ULE3 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms