Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL41

PNMA3, Paraneoplastic antigen Ma3, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA3Q9UL41 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PNMA3Q9UL41 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PNMA3Q9UL41 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PNMA3Q9UL41 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PNMA3Q9UL41 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PNMA3Q9UL41 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PNMA3Q9UL41 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PNMA3Q9UL41 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PNMA3Q9UL41 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PNMA3Q9UL41 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PNMA3Q9UL41 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PNMA3Q9UL41 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PNMA3Q9UL41 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PNMA3Q9UL41 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PNMA3Q9UL41 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PNMA3Q9UL41 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PNMA3Q9UL41 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PNMA3Q9UL41 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PNMA3Q9UL41 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PNMA3Q9UL41 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PNMA3Q9UL41 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PNMA3Q9UL41 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PNMA3Q9UL41 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PNMA3Q9UL41 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PNMA3Q9UL41 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PNMA3Q9UL41 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PNMA3Q9UL41 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PNMA3Q9UL41 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PNMA3Q9UL41 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PNMA3Q9UL41 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PNMA3Q9UL41 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PNMA3Q9UL41 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PNMA3Q9UL41 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PNMA3Q9UL41 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PNMA3Q9UL41 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PNMA3Q9UL41 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PNMA3Q9UL41 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PNMA3Q9UL41 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PNMA3Q9UL41 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PNMA3Q9UL41 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PNMA3Q9UL41 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PNMA3Q9UL41 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PNMA3Q9UL41 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PNMA3Q9UL41 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PNMA3Q9UL41 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PNMA3Q9UL41 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PNMA3Q9UL41 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PNMA3Q9UL41 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PNMA3Q9UL41 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PNMA3Q9UL41 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PNMA3Q9UL41 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PNMA3Q9UL41 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PNMA3Q9UL41 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PNMA3Q9UL41 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PNMA3Q9UL41 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PNMA3Q9UL41 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PNMA3Q9UL41 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PNMA3Q9UL41 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PNMA3Q9UL41 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PNMA3Q9UL41 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PNMA3Q9UL41 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PNMA3Q9UL41 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PNMA3Q9UL41 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PNMA3Q9UL41 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PNMA3Q9UL41 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PNMA3Q9UL41 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PNMA3Q9UL41 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PNMA3Q9UL41 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PNMA3Q9UL41 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PNMA3Q9UL41 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PNMA3Q9UL41 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PNMA3Q9UL41 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PNMA3Q9UL41 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PNMA3Q9UL41 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PNMA3Q9UL41 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PNMA3Q9UL41 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PNMA3Q9UL41 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
PNMA3Q9UL41 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PNMA3Q9UL41 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PNMA3Q9UL41 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PNMA3Q9UL41 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PNMA3Q9UL41 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PNMA3Q9UL41 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PNMA3Q9UL41 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PNMA3Q9UL41 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PNMA3Q9UL41 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PNMA3Q9UL41 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PNMA3Q9UL41 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PNMA3Q9UL41 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PNMA3Q9UL41 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PNMA3Q9UL41 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PNMA3Q9UL41 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PNMA3Q9UL41 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PNMA3Q9UL41 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PNMA3Q9UL41 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PNMA3Q9UL41 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PNMA3Q9UL41 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PNMA3Q9UL41 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PNMA3Q9UL41 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PNMA3Q9UL41 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms