Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKX5

ITGA11, Integrin alpha-11, humanhuman

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA11Q9UKX5 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGA11Q9UKX5 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGA11Q9UKX5 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGA11Q9UKX5 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGA11Q9UKX5 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGA11Q9UKX5 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGA11Q9UKX5 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGA11Q9UKX5 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGA11Q9UKX5 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGA11Q9UKX5 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGA11Q9UKX5 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGA11Q9UKX5 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGA11Q9UKX5 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGA11Q9UKX5 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGA11Q9UKX5 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGA11Q9UKX5 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGA11Q9UKX5 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGA11Q9UKX5 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGA11Q9UKX5 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGA11Q9UKX5 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGA11Q9UKX5 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGA11Q9UKX5 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGA11Q9UKX5 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGA11Q9UKX5 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGA11Q9UKX5 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGA11Q9UKX5 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGA11Q9UKX5 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGA11Q9UKX5 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGA11Q9UKX5 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGA11Q9UKX5 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGA11Q9UKX5 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGA11Q9UKX5 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGA11Q9UKX5 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGA11Q9UKX5 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGA11Q9UKX5 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGA11Q9UKX5 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGA11Q9UKX5 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGA11Q9UKX5 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGA11Q9UKX5 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGA11Q9UKX5 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGA11Q9UKX5 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGA11Q9UKX5 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGA11Q9UKX5 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGA11Q9UKX5 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGA11Q9UKX5 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGA11Q9UKX5 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGA11Q9UKX5 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGA11Q9UKX5 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGA11Q9UKX5 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGA11Q9UKX5 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGA11Q9UKX5 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGA11Q9UKX5 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGA11Q9UKX5 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGA11Q9UKX5 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGA11Q9UKX5 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGA11Q9UKX5 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGA11Q9UKX5 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ITGA11Q9UKX5 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ITGA11Q9UKX5 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ITGA11Q9UKX5 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ITGA11Q9UKX5 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ITGA11Q9UKX5 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ITGA11Q9UKX5 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ITGA11Q9UKX5 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGA11Q9UKX5 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGA11Q9UKX5 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGA11Q9UKX5 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGA11Q9UKX5 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGA11Q9UKX5 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGA11Q9UKX5 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGA11Q9UKX5 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGA11Q9UKX5 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGA11Q9UKX5 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGA11Q9UKX5 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGA11Q9UKX5 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGA11Q9UKX5 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGA11Q9UKX5 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGA11Q9UKX5 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGA11Q9UKX5 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGA11Q9UKX5 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGA11Q9UKX5 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGA11Q9UKX5 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGA11Q9UKX5 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGA11Q9UKX5 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGA11Q9UKX5 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGA11Q9UKX5 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGA11Q9UKX5 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGA11Q9UKX5 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGA11Q9UKX5 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGA11Q9UKX5 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGA11Q9UKX5 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGA11Q9UKX5 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGA11Q9UKX5 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGA11Q9UKX5 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGA11Q9UKX5 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGA11Q9UKX5 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGA11Q9UKX5 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGA11Q9UKX5 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGA11Q9UKX5 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGA11Q9UKX5 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms