Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTNNA3Q9UI47 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTNNA3Q9UI47 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTNNA3Q9UI47 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTNNA3Q9UI47 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTNNA3Q9UI47 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTNNA3Q9UI47 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTNNA3Q9UI47 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTNNA3Q9UI47 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTNNA3Q9UI47 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CTNNA3Q9UI47 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTNNA3Q9UI47 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTNNA3Q9UI47 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTNNA3Q9UI47 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTNNA3Q9UI47 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CTNNA3Q9UI47 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTNNA3Q9UI47 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTNNA3Q9UI47 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTNNA3Q9UI47 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTNNA3Q9UI47 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTNNA3Q9UI47 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTNNA3Q9UI47 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTNNA3Q9UI47 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTNNA3Q9UI47 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CTNNA3Q9UI47 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CTNNA3Q9UI47 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CTNNA3Q9UI47 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CTNNA3Q9UI47 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CTNNA3Q9UI47 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CTNNA3Q9UI47 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CTNNA3Q9UI47 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CTNNA3Q9UI47 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CTNNA3Q9UI47 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CTNNA3Q9UI47 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CTNNA3Q9UI47 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CTNNA3Q9UI47 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CTNNA3Q9UI47 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CTNNA3Q9UI47 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CTNNA3Q9UI47 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CTNNA3Q9UI47 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CTNNA3Q9UI47 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CTNNA3Q9UI47 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CTNNA3Q9UI47 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CTNNA3Q9UI47 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CTNNA3Q9UI47 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CTNNA3Q9UI47 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CTNNA3Q9UI47 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CTNNA3Q9UI47 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CTNNA3Q9UI47 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CTNNA3Q9UI47 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CTNNA3Q9UI47 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CTNNA3Q9UI47 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CTNNA3Q9UI47 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CTNNA3Q9UI47 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CTNNA3Q9UI47 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CTNNA3Q9UI47 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CTNNA3Q9UI47 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CTNNA3Q9UI47 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CTNNA3Q9UI47 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CTNNA3Q9UI47 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CTNNA3Q9UI47 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTNNA3Q9UI47 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTNNA3Q9UI47 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTNNA3Q9UI47 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTNNA3Q9UI47 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTNNA3Q9UI47 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTNNA3Q9UI47 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTNNA3Q9UI47 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTNNA3Q9UI47 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTNNA3Q9UI47 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTNNA3Q9UI47 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTNNA3Q9UI47 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTNNA3Q9UI47 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTNNA3Q9UI47 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTNNA3Q9UI47 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CTNNA3Q9UI47 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTNNA3Q9UI47 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTNNA3Q9UI47 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTNNA3Q9UI47 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTNNA3Q9UI47 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CTNNA3Q9UI47 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTNNA3Q9UI47 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CTNNA3Q9UI47 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTNNA3Q9UI47 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTNNA3Q9UI47 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTNNA3Q9UI47 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTNNA3Q9UI47 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTNNA3Q9UI47 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CTNNA3Q9UI47 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTNNA3Q9UI47 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTNNA3Q9UI47 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTNNA3Q9UI47 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTNNA3Q9UI47 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTNNA3Q9UI47 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTNNA3Q9UI47 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTNNA3Q9UI47 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTNNA3Q9UI47 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CTNNA3Q9UI47 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTNNA3Q9UI47 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTNNA3Q9UI47 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms