Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGU5

HMGXB4, HMG domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB4Q9UGU5 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HMGXB4Q9UGU5 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HMGXB4Q9UGU5 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HMGXB4Q9UGU5 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HMGXB4Q9UGU5 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HMGXB4Q9UGU5 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HMGXB4Q9UGU5 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HMGXB4Q9UGU5 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HMGXB4Q9UGU5 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HMGXB4Q9UGU5 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HMGXB4Q9UGU5 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HMGXB4Q9UGU5 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HMGXB4Q9UGU5 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HMGXB4Q9UGU5 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HMGXB4Q9UGU5 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HMGXB4Q9UGU5 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HMGXB4Q9UGU5 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HMGXB4Q9UGU5 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HMGXB4Q9UGU5 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HMGXB4Q9UGU5 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HMGXB4Q9UGU5 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HMGXB4Q9UGU5 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HMGXB4Q9UGU5 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HMGXB4Q9UGU5 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HMGXB4Q9UGU5 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HMGXB4Q9UGU5 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HMGXB4Q9UGU5 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HMGXB4Q9UGU5 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HMGXB4Q9UGU5 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HMGXB4Q9UGU5 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HMGXB4Q9UGU5 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HMGXB4Q9UGU5 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HMGXB4Q9UGU5 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HMGXB4Q9UGU5 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HMGXB4Q9UGU5 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HMGXB4Q9UGU5 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HMGXB4Q9UGU5 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HMGXB4Q9UGU5 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HMGXB4Q9UGU5 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HMGXB4Q9UGU5 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HMGXB4Q9UGU5 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HMGXB4Q9UGU5 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HMGXB4Q9UGU5 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HMGXB4Q9UGU5 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HMGXB4Q9UGU5 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HMGXB4Q9UGU5 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HMGXB4Q9UGU5 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HMGXB4Q9UGU5 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HMGXB4Q9UGU5 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HMGXB4Q9UGU5 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HMGXB4Q9UGU5 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HMGXB4Q9UGU5 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HMGXB4Q9UGU5 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HMGXB4Q9UGU5 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HMGXB4Q9UGU5 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HMGXB4Q9UGU5 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HMGXB4Q9UGU5 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HMGXB4Q9UGU5 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HMGXB4Q9UGU5 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HMGXB4Q9UGU5 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HMGXB4Q9UGU5 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HMGXB4Q9UGU5 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HMGXB4Q9UGU5 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HMGXB4Q9UGU5 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HMGXB4Q9UGU5 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HMGXB4Q9UGU5 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HMGXB4Q9UGU5 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HMGXB4Q9UGU5 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HMGXB4Q9UGU5 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HMGXB4Q9UGU5 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HMGXB4Q9UGU5 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HMGXB4Q9UGU5 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HMGXB4Q9UGU5 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HMGXB4Q9UGU5 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HMGXB4Q9UGU5 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HMGXB4Q9UGU5 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HMGXB4Q9UGU5 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HMGXB4Q9UGU5 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HMGXB4Q9UGU5 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HMGXB4Q9UGU5 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HMGXB4Q9UGU5 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HMGXB4Q9UGU5 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HMGXB4Q9UGU5 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HMGXB4Q9UGU5 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HMGXB4Q9UGU5 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HMGXB4Q9UGU5 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HMGXB4Q9UGU5 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HMGXB4Q9UGU5 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HMGXB4Q9UGU5 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HMGXB4Q9UGU5 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HMGXB4Q9UGU5 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HMGXB4Q9UGU5 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HMGXB4Q9UGU5 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HMGXB4Q9UGU5 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HMGXB4Q9UGU5 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HMGXB4Q9UGU5 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HMGXB4Q9UGU5 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HMGXB4Q9UGU5 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HMGXB4Q9UGU5 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HMGXB4Q9UGU5 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.4 ms