Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGU0

TCF20, Transcription factor 20, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,960 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF20Q9UGU0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TCF20Q9UGU0 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TCF20Q9UGU0 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TCF20Q9UGU0 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TCF20Q9UGU0 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TCF20Q9UGU0 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TCF20Q9UGU0 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TCF20Q9UGU0 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TCF20Q9UGU0 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TCF20Q9UGU0 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TCF20Q9UGU0 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TCF20Q9UGU0 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TCF20Q9UGU0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TCF20Q9UGU0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TCF20Q9UGU0 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TCF20Q9UGU0 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TCF20Q9UGU0 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TCF20Q9UGU0 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TCF20Q9UGU0 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TCF20Q9UGU0 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TCF20Q9UGU0 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TCF20Q9UGU0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TCF20Q9UGU0 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TCF20Q9UGU0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TCF20Q9UGU0 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TCF20Q9UGU0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCF20Q9UGU0 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCF20Q9UGU0 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TCF20Q9UGU0 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCF20Q9UGU0 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCF20Q9UGU0 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCF20Q9UGU0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCF20Q9UGU0 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCF20Q9UGU0 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCF20Q9UGU0 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCF20Q9UGU0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCF20Q9UGU0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCF20Q9UGU0 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCF20Q9UGU0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TCF20Q9UGU0 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TCF20Q9UGU0 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TCF20Q9UGU0 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TCF20Q9UGU0 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TCF20Q9UGU0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TCF20Q9UGU0 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TCF20Q9UGU0 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TCF20Q9UGU0 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TCF20Q9UGU0 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TCF20Q9UGU0 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TCF20Q9UGU0 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TCF20Q9UGU0 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TCF20Q9UGU0 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TCF20Q9UGU0 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TCF20Q9UGU0 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TCF20Q9UGU0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TCF20Q9UGU0 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TCF20Q9UGU0 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TCF20Q9UGU0 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TCF20Q9UGU0 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TCF20Q9UGU0 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TCF20Q9UGU0 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TCF20Q9UGU0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TCF20Q9UGU0 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TCF20Q9UGU0 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TCF20Q9UGU0 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TCF20Q9UGU0 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TCF20Q9UGU0 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TCF20Q9UGU0 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TCF20Q9UGU0 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TCF20Q9UGU0 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TCF20Q9UGU0 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TCF20Q9UGU0 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TCF20Q9UGU0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TCF20Q9UGU0 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TCF20Q9UGU0 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TCF20Q9UGU0 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TCF20Q9UGU0 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TCF20Q9UGU0 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TCF20Q9UGU0 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TCF20Q9UGU0 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TCF20Q9UGU0 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TCF20Q9UGU0 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TCF20Q9UGU0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TCF20Q9UGU0 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TCF20Q9UGU0 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TCF20Q9UGU0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TCF20Q9UGU0 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TCF20Q9UGU0 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TCF20Q9UGU0 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TCF20Q9UGU0 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TCF20Q9UGU0 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TCF20Q9UGU0 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TCF20Q9UGU0 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TCF20Q9UGU0 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
TCF20Q9UGU0 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TCF20Q9UGU0 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TCF20Q9UGU0 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TCF20Q9UGU0 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TCF20Q9UGU0 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TCF20Q9UGU0 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms