Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLIP2Q9UDT6 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLIP2Q9UDT6 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLIP2Q9UDT6 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLIP2Q9UDT6 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLIP2Q9UDT6 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLIP2Q9UDT6 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CLIP2Q9UDT6 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLIP2Q9UDT6 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLIP2Q9UDT6 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLIP2Q9UDT6 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLIP2Q9UDT6 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLIP2Q9UDT6 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLIP2Q9UDT6 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLIP2Q9UDT6 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLIP2Q9UDT6 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CLIP2Q9UDT6 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLIP2Q9UDT6 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLIP2Q9UDT6 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLIP2Q9UDT6 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLIP2Q9UDT6 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLIP2Q9UDT6 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLIP2Q9UDT6 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLIP2Q9UDT6 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLIP2Q9UDT6 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLIP2Q9UDT6 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLIP2Q9UDT6 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLIP2Q9UDT6 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLIP2Q9UDT6 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLIP2Q9UDT6 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLIP2Q9UDT6 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLIP2Q9UDT6 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLIP2Q9UDT6 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLIP2Q9UDT6 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLIP2Q9UDT6 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLIP2Q9UDT6 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLIP2Q9UDT6 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLIP2Q9UDT6 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CLIP2Q9UDT6 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLIP2Q9UDT6 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CLIP2Q9UDT6 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLIP2Q9UDT6 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLIP2Q9UDT6 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLIP2Q9UDT6 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CLIP2Q9UDT6 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CLIP2Q9UDT6 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLIP2Q9UDT6 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLIP2Q9UDT6 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLIP2Q9UDT6 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLIP2Q9UDT6 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLIP2Q9UDT6 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLIP2Q9UDT6 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLIP2Q9UDT6 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLIP2Q9UDT6 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLIP2Q9UDT6 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLIP2Q9UDT6 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLIP2Q9UDT6 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLIP2Q9UDT6 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLIP2Q9UDT6 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLIP2Q9UDT6 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLIP2Q9UDT6 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLIP2Q9UDT6 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLIP2Q9UDT6 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLIP2Q9UDT6 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLIP2Q9UDT6 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CLIP2Q9UDT6 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
CLIP2Q9UDT6 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CLIP2Q9UDT6 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CLIP2Q9UDT6 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CLIP2Q9UDT6 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLIP2Q9UDT6 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CLIP2Q9UDT6 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLIP2Q9UDT6 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLIP2Q9UDT6 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLIP2Q9UDT6 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLIP2Q9UDT6 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLIP2Q9UDT6 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLIP2Q9UDT6 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLIP2Q9UDT6 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLIP2Q9UDT6 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLIP2Q9UDT6 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLIP2Q9UDT6 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLIP2Q9UDT6 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLIP2Q9UDT6 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLIP2Q9UDT6 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLIP2Q9UDT6 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLIP2Q9UDT6 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLIP2Q9UDT6 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLIP2Q9UDT6 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CLIP2Q9UDT6 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLIP2Q9UDT6 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLIP2Q9UDT6 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLIP2Q9UDT6 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLIP2Q9UDT6 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLIP2Q9UDT6 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLIP2Q9UDT6 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLIP2Q9UDT6 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLIP2Q9UDT6 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLIP2Q9UDT6 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLIP2Q9UDT6 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms