Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
APEX2Q9UBZ4 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APEX2Q9UBZ4 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APEX2Q9UBZ4 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APEX2Q9UBZ4 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APEX2Q9UBZ4 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APEX2Q9UBZ4 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APEX2Q9UBZ4 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APEX2Q9UBZ4 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APEX2Q9UBZ4 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APEX2Q9UBZ4 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APEX2Q9UBZ4 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APEX2Q9UBZ4 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
APEX2Q9UBZ4 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APEX2Q9UBZ4 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APEX2Q9UBZ4 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APEX2Q9UBZ4 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APEX2Q9UBZ4 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APEX2Q9UBZ4 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APEX2Q9UBZ4 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APEX2Q9UBZ4 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APEX2Q9UBZ4 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APEX2Q9UBZ4 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APEX2Q9UBZ4 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APEX2Q9UBZ4 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APEX2Q9UBZ4 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APEX2Q9UBZ4 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APEX2Q9UBZ4 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APEX2Q9UBZ4 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APEX2Q9UBZ4 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APEX2Q9UBZ4 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APEX2Q9UBZ4 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APEX2Q9UBZ4 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APEX2Q9UBZ4 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APEX2Q9UBZ4 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APEX2Q9UBZ4 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APEX2Q9UBZ4 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APEX2Q9UBZ4 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APEX2Q9UBZ4 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APEX2Q9UBZ4 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
APEX2Q9UBZ4 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APEX2Q9UBZ4 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APEX2Q9UBZ4 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APEX2Q9UBZ4 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APEX2Q9UBZ4 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APEX2Q9UBZ4 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APEX2Q9UBZ4 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
APEX2Q9UBZ4 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APEX2Q9UBZ4 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APEX2Q9UBZ4 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APEX2Q9UBZ4 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APEX2Q9UBZ4 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APEX2Q9UBZ4 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APEX2Q9UBZ4 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APEX2Q9UBZ4 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
APEX2Q9UBZ4 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APEX2Q9UBZ4 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
APEX2Q9UBZ4 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APEX2Q9UBZ4 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APEX2Q9UBZ4 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APEX2Q9UBZ4 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APEX2Q9UBZ4 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APEX2Q9UBZ4 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APEX2Q9UBZ4 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APEX2Q9UBZ4 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
APEX2Q9UBZ4 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APEX2Q9UBZ4 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APEX2Q9UBZ4 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APEX2Q9UBZ4 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APEX2Q9UBZ4 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APEX2Q9UBZ4 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
APEX2Q9UBZ4 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
APEX2Q9UBZ4 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
APEX2Q9UBZ4 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
APEX2Q9UBZ4 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
APEX2Q9UBZ4 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
APEX2Q9UBZ4 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APEX2Q9UBZ4 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
APEX2Q9UBZ4 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APEX2Q9UBZ4 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
APEX2Q9UBZ4 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
APEX2Q9UBZ4 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
APEX2Q9UBZ4 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
APEX2Q9UBZ4 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
APEX2Q9UBZ4 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APEX2Q9UBZ4 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APEX2Q9UBZ4 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APEX2Q9UBZ4 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APEX2Q9UBZ4 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APEX2Q9UBZ4 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APEX2Q9UBZ4 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APEX2Q9UBZ4 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APEX2Q9UBZ4 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APEX2Q9UBZ4 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APEX2Q9UBZ4 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APEX2Q9UBZ4 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APEX2Q9UBZ4 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APEX2Q9UBZ4 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APEX2Q9UBZ4 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APEX2Q9UBZ4 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms