Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN1

CACNG4, Voltage-dependent calcium channel gamma-4 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG4Q9UBN1 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNG4Q9UBN1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNG4Q9UBN1 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNG4Q9UBN1 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNG4Q9UBN1 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNG4Q9UBN1 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNG4Q9UBN1 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNG4Q9UBN1 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNG4Q9UBN1 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNG4Q9UBN1 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNG4Q9UBN1 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNG4Q9UBN1 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNG4Q9UBN1 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNG4Q9UBN1 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNG4Q9UBN1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNG4Q9UBN1 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNG4Q9UBN1 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNG4Q9UBN1 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNG4Q9UBN1 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNG4Q9UBN1 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNG4Q9UBN1 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNG4Q9UBN1 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNG4Q9UBN1 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNG4Q9UBN1 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNG4Q9UBN1 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNG4Q9UBN1 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNG4Q9UBN1 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNG4Q9UBN1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNG4Q9UBN1 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CACNG4Q9UBN1 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CACNG4Q9UBN1 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
CACNG4Q9UBN1 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CACNG4Q9UBN1 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNG4Q9UBN1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNG4Q9UBN1 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNG4Q9UBN1 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNG4Q9UBN1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNG4Q9UBN1 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNG4Q9UBN1 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNG4Q9UBN1 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNG4Q9UBN1 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNG4Q9UBN1 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNG4Q9UBN1 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNG4Q9UBN1 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNG4Q9UBN1 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNG4Q9UBN1 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNG4Q9UBN1 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNG4Q9UBN1 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNG4Q9UBN1 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNG4Q9UBN1 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNG4Q9UBN1 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNG4Q9UBN1 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNG4Q9UBN1 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNG4Q9UBN1 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNG4Q9UBN1 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNG4Q9UBN1 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNG4Q9UBN1 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNG4Q9UBN1 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNG4Q9UBN1 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNG4Q9UBN1 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNG4Q9UBN1 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNG4Q9UBN1 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNG4Q9UBN1 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNG4Q9UBN1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNG4Q9UBN1 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNG4Q9UBN1 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNG4Q9UBN1 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNG4Q9UBN1 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNG4Q9UBN1 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNG4Q9UBN1 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNG4Q9UBN1 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNG4Q9UBN1 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNG4Q9UBN1 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNG4Q9UBN1 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNG4Q9UBN1 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNG4Q9UBN1 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNG4Q9UBN1 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNG4Q9UBN1 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNG4Q9UBN1 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNG4Q9UBN1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNG4Q9UBN1 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNG4Q9UBN1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNG4Q9UBN1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNG4Q9UBN1 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNG4Q9UBN1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNG4Q9UBN1 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNG4Q9UBN1 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNG4Q9UBN1 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNG4Q9UBN1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNG4Q9UBN1 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNG4Q9UBN1 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNG4Q9UBN1 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNG4Q9UBN1 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNG4Q9UBN1 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNG4Q9UBN1 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNG4Q9UBN1 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNG4Q9UBN1 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNG4Q9UBN1 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNG4Q9UBN1 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNG4Q9UBN1 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms