Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD3

XCL2, Cytokine SCM-1 beta, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL2Q9UBD3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XCL2Q9UBD3 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
XCL2Q9UBD3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XCL2Q9UBD3 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XCL2Q9UBD3 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XCL2Q9UBD3 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
XCL2Q9UBD3 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XCL2Q9UBD3 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XCL2Q9UBD3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
XCL2Q9UBD3 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
XCL2Q9UBD3 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
XCL2Q9UBD3 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
XCL2Q9UBD3 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
XCL2Q9UBD3 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
XCL2Q9UBD3 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
XCL2Q9UBD3 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
XCL2Q9UBD3 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
XCL2Q9UBD3 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
XCL2Q9UBD3 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
XCL2Q9UBD3 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
XCL2Q9UBD3 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
XCL2Q9UBD3 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
XCL2Q9UBD3 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
XCL2Q9UBD3 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
XCL2Q9UBD3 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
XCL2Q9UBD3 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
XCL2Q9UBD3 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
XCL2Q9UBD3 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
XCL2Q9UBD3 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
XCL2Q9UBD3 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
XCL2Q9UBD3 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
XCL2Q9UBD3 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
XCL2Q9UBD3 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
XCL2Q9UBD3 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
XCL2Q9UBD3 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
XCL2Q9UBD3 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
XCL2Q9UBD3 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
XCL2Q9UBD3 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
XCL2Q9UBD3 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
XCL2Q9UBD3 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
XCL2Q9UBD3 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
XCL2Q9UBD3 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
XCL2Q9UBD3 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
XCL2Q9UBD3 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
XCL2Q9UBD3 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
XCL2Q9UBD3 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
XCL2Q9UBD3 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
XCL2Q9UBD3 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
XCL2Q9UBD3 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
XCL2Q9UBD3 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
XCL2Q9UBD3 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
XCL2Q9UBD3 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
XCL2Q9UBD3 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
XCL2Q9UBD3 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
XCL2Q9UBD3 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
XCL2Q9UBD3 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
XCL2Q9UBD3 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
XCL2Q9UBD3 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
XCL2Q9UBD3 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
XCL2Q9UBD3 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
XCL2Q9UBD3 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
XCL2Q9UBD3 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
XCL2Q9UBD3 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
XCL2Q9UBD3 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
XCL2Q9UBD3 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
XCL2Q9UBD3 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
XCL2Q9UBD3 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
XCL2Q9UBD3 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
XCL2Q9UBD3 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
XCL2Q9UBD3 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
XCL2Q9UBD3 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
XCL2Q9UBD3 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
XCL2Q9UBD3 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
XCL2Q9UBD3 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
XCL2Q9UBD3 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
XCL2Q9UBD3 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
XCL2Q9UBD3 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
XCL2Q9UBD3 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
XCL2Q9UBD3 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
XCL2Q9UBD3 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
XCL2Q9UBD3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
XCL2Q9UBD3 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
XCL2Q9UBD3 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
XCL2Q9UBD3 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
XCL2Q9UBD3 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
XCL2Q9UBD3 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
XCL2Q9UBD3 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
XCL2Q9UBD3 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
XCL2Q9UBD3 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
XCL2Q9UBD3 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
XCL2Q9UBD3 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
XCL2Q9UBD3 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
XCL2Q9UBD3 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
XCL2Q9UBD3 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
XCL2Q9UBD3 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
XCL2Q9UBD3 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
XCL2Q9UBD3 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
XCL2Q9UBD3 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
XCL2Q9UBD3 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
XCL2Q9UBD3 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms