Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KLHL42Q9P2K6 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KLHL42Q9P2K6 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KLHL42Q9P2K6 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KLHL42Q9P2K6 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KLHL42Q9P2K6 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KLHL42Q9P2K6 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KLHL42Q9P2K6 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KLHL42Q9P2K6 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KLHL42Q9P2K6 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
KLHL42Q9P2K6 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KLHL42Q9P2K6 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KLHL42Q9P2K6 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KLHL42Q9P2K6 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
KLHL42Q9P2K6 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
KLHL42Q9P2K6 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
KLHL42Q9P2K6 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
KLHL42Q9P2K6 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
KLHL42Q9P2K6 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL42Q9P2K6 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL42Q9P2K6 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL42Q9P2K6 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL42Q9P2K6 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL42Q9P2K6 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL42Q9P2K6 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL42Q9P2K6 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL42Q9P2K6 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL42Q9P2K6 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL42Q9P2K6 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL42Q9P2K6 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL42Q9P2K6 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL42Q9P2K6 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL42Q9P2K6 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL42Q9P2K6 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL42Q9P2K6 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL42Q9P2K6 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL42Q9P2K6 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL42Q9P2K6 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL42Q9P2K6 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL42Q9P2K6 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL42Q9P2K6 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL42Q9P2K6 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL42Q9P2K6 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL42Q9P2K6 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL42Q9P2K6 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL42Q9P2K6 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL42Q9P2K6 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL42Q9P2K6 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL42Q9P2K6 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL42Q9P2K6 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL42Q9P2K6 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL42Q9P2K6 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL42Q9P2K6 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL42Q9P2K6 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL42Q9P2K6 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL42Q9P2K6 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL42Q9P2K6 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL42Q9P2K6 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL42Q9P2K6 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL42Q9P2K6 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL42Q9P2K6 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL42Q9P2K6 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL42Q9P2K6 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL42Q9P2K6 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL42Q9P2K6 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL42Q9P2K6 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL42Q9P2K6 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL42Q9P2K6 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL42Q9P2K6 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL42Q9P2K6 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL42Q9P2K6 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL42Q9P2K6 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL42Q9P2K6 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL42Q9P2K6 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL42Q9P2K6 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL42Q9P2K6 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL42Q9P2K6 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL42Q9P2K6 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL42Q9P2K6 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL42Q9P2K6 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL42Q9P2K6 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL42Q9P2K6 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL42Q9P2K6 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL42Q9P2K6 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL42Q9P2K6 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL42Q9P2K6 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL42Q9P2K6 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL42Q9P2K6 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL42Q9P2K6 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL42Q9P2K6 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL42Q9P2K6 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL42Q9P2K6 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL42Q9P2K6 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL42Q9P2K6 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLHL42Q9P2K6 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLHL42Q9P2K6 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLHL42Q9P2K6 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
KLHL42Q9P2K6 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLHL42Q9P2K6 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLHL42Q9P2K6 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms