Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0U4

CXXC1, CXXC-type zinc finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXXC1Q9P0U4 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CXXC1Q9P0U4 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CXXC1Q9P0U4 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CXXC1Q9P0U4 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CXXC1Q9P0U4 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CXXC1Q9P0U4 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CXXC1Q9P0U4 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CXXC1Q9P0U4 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CXXC1Q9P0U4 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CXXC1Q9P0U4 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CXXC1Q9P0U4 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CXXC1Q9P0U4 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CXXC1Q9P0U4 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CXXC1Q9P0U4 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CXXC1Q9P0U4 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CXXC1Q9P0U4 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CXXC1Q9P0U4 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CXXC1Q9P0U4 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CXXC1Q9P0U4 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CXXC1Q9P0U4 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CXXC1Q9P0U4 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CXXC1Q9P0U4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CXXC1Q9P0U4 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CXXC1Q9P0U4 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CXXC1Q9P0U4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CXXC1Q9P0U4 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CXXC1Q9P0U4 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CXXC1Q9P0U4 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CXXC1Q9P0U4 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CXXC1Q9P0U4 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CXXC1Q9P0U4 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CXXC1Q9P0U4 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CXXC1Q9P0U4 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CXXC1Q9P0U4 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CXXC1Q9P0U4 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CXXC1Q9P0U4 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CXXC1Q9P0U4 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CXXC1Q9P0U4 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CXXC1Q9P0U4 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CXXC1Q9P0U4 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CXXC1Q9P0U4 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CXXC1Q9P0U4 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CXXC1Q9P0U4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CXXC1Q9P0U4 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CXXC1Q9P0U4 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CXXC1Q9P0U4 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CXXC1Q9P0U4 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CXXC1Q9P0U4 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CXXC1Q9P0U4 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CXXC1Q9P0U4 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CXXC1Q9P0U4 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CXXC1Q9P0U4 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CXXC1Q9P0U4 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CXXC1Q9P0U4 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CXXC1Q9P0U4 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CXXC1Q9P0U4 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CXXC1Q9P0U4 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CXXC1Q9P0U4 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CXXC1Q9P0U4 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CXXC1Q9P0U4 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CXXC1Q9P0U4 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CXXC1Q9P0U4 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CXXC1Q9P0U4 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CXXC1Q9P0U4 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CXXC1Q9P0U4 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CXXC1Q9P0U4 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CXXC1Q9P0U4 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CXXC1Q9P0U4 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CXXC1Q9P0U4 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CXXC1Q9P0U4 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CXXC1Q9P0U4 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CXXC1Q9P0U4 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CXXC1Q9P0U4 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CXXC1Q9P0U4 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CXXC1Q9P0U4 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CXXC1Q9P0U4 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CXXC1Q9P0U4 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CXXC1Q9P0U4 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CXXC1Q9P0U4 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CXXC1Q9P0U4 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CXXC1Q9P0U4 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CXXC1Q9P0U4 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CXXC1Q9P0U4 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CXXC1Q9P0U4 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CXXC1Q9P0U4 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CXXC1Q9P0U4 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CXXC1Q9P0U4 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CXXC1Q9P0U4 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CXXC1Q9P0U4 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CXXC1Q9P0U4 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CXXC1Q9P0U4 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CXXC1Q9P0U4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CXXC1Q9P0U4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CXXC1Q9P0U4 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CXXC1Q9P0U4 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CXXC1Q9P0U4 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CXXC1Q9P0U4 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CXXC1Q9P0U4 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CXXC1Q9P0U4 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CXXC1Q9P0U4 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms