Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
EHD3Q9NZN3 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
EHD3Q9NZN3 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
EHD3Q9NZN3 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
EHD3Q9NZN3 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
EHD3Q9NZN3 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
EHD3Q9NZN3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
EHD3Q9NZN3 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
EHD3Q9NZN3 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
EHD3Q9NZN3 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
EHD3Q9NZN3 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
EHD3Q9NZN3 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
EHD3Q9NZN3 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
EHD3Q9NZN3 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
EHD3Q9NZN3 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
EHD3Q9NZN3 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
EHD3Q9NZN3 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
EHD3Q9NZN3 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
EHD3Q9NZN3 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
EHD3Q9NZN3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
EHD3Q9NZN3 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
EHD3Q9NZN3 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
EHD3Q9NZN3 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
EHD3Q9NZN3 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
EHD3Q9NZN3 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
EHD3Q9NZN3 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
EHD3Q9NZN3 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
EHD3Q9NZN3 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
EHD3Q9NZN3 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
EHD3Q9NZN3 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
EHD3Q9NZN3 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
EHD3Q9NZN3 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
EHD3Q9NZN3 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
EHD3Q9NZN3 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
EHD3Q9NZN3 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
EHD3Q9NZN3 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
EHD3Q9NZN3 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
EHD3Q9NZN3 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
EHD3Q9NZN3 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
EHD3Q9NZN3 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
EHD3Q9NZN3 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
EHD3Q9NZN3 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
EHD3Q9NZN3 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
EHD3Q9NZN3 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
EHD3Q9NZN3 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
EHD3Q9NZN3 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
EHD3Q9NZN3 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
EHD3Q9NZN3 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
EHD3Q9NZN3 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
EHD3Q9NZN3 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
EHD3Q9NZN3 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
EHD3Q9NZN3 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
EHD3Q9NZN3 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
EHD3Q9NZN3 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
EHD3Q9NZN3 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
EHD3Q9NZN3 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
EHD3Q9NZN3 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
EHD3Q9NZN3 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
EHD3Q9NZN3 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
EHD3Q9NZN3 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
EHD3Q9NZN3 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
EHD3Q9NZN3 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
EHD3Q9NZN3 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
EHD3Q9NZN3 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
EHD3Q9NZN3 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
EHD3Q9NZN3 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
EHD3Q9NZN3 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
EHD3Q9NZN3 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
EHD3Q9NZN3 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
EHD3Q9NZN3 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
EHD3Q9NZN3 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
EHD3Q9NZN3 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
EHD3Q9NZN3 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
EHD3Q9NZN3 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
EHD3Q9NZN3 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
EHD3Q9NZN3 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
EHD3Q9NZN3 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
EHD3Q9NZN3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
EHD3Q9NZN3 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
EHD3Q9NZN3 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
EHD3Q9NZN3 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
EHD3Q9NZN3 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
EHD3Q9NZN3 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
EHD3Q9NZN3 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
EHD3Q9NZN3 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
EHD3Q9NZN3 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
EHD3Q9NZN3 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
EHD3Q9NZN3 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
EHD3Q9NZN3 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
EHD3Q9NZN3 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
EHD3Q9NZN3 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
EHD3Q9NZN3 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
EHD3Q9NZN3 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
EHD3Q9NZN3 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
EHD3Q9NZN3 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
EHD3Q9NZN3 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
EHD3Q9NZN3 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
EHD3Q9NZN3 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
EHD3Q9NZN3 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
EHD3Q9NZN3 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms