Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYL9

TMOD3, Tropomodulin-3, humanhuman

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3Q9NYL9 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMOD3Q9NYL9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
TMOD3Q9NYL9 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TMOD3Q9NYL9 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TMOD3Q9NYL9 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
TMOD3Q9NYL9 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
TMOD3Q9NYL9 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TMOD3Q9NYL9 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TMOD3Q9NYL9 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TMOD3Q9NYL9 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TMOD3Q9NYL9 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
TMOD3Q9NYL9 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TMOD3Q9NYL9 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TMOD3Q9NYL9 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TMOD3Q9NYL9 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TMOD3Q9NYL9 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TMOD3Q9NYL9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TMOD3Q9NYL9 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TMOD3Q9NYL9 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TMOD3Q9NYL9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TMOD3Q9NYL9 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TMOD3Q9NYL9 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TMOD3Q9NYL9 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TMOD3Q9NYL9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TMOD3Q9NYL9 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TMOD3Q9NYL9 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TMOD3Q9NYL9 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TMOD3Q9NYL9 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TMOD3Q9NYL9 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TMOD3Q9NYL9 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TMOD3Q9NYL9 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMOD3Q9NYL9 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
TMOD3Q9NYL9 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMOD3Q9NYL9 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMOD3Q9NYL9 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMOD3Q9NYL9 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMOD3Q9NYL9 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMOD3Q9NYL9 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
TMOD3Q9NYL9 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMOD3Q9NYL9 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMOD3Q9NYL9 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMOD3Q9NYL9 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMOD3Q9NYL9 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMOD3Q9NYL9 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMOD3Q9NYL9 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMOD3Q9NYL9 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMOD3Q9NYL9 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMOD3Q9NYL9 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMOD3Q9NYL9 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMOD3Q9NYL9 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
TMOD3Q9NYL9 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
TMOD3Q9NYL9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMOD3Q9NYL9 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMOD3Q9NYL9 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMOD3Q9NYL9 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMOD3Q9NYL9 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMOD3Q9NYL9 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMOD3Q9NYL9 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMOD3Q9NYL9 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMOD3Q9NYL9 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMOD3Q9NYL9 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMOD3Q9NYL9 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMOD3Q9NYL9 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMOD3Q9NYL9 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMOD3Q9NYL9 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMOD3Q9NYL9 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMOD3Q9NYL9 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMOD3Q9NYL9 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMOD3Q9NYL9 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
TMOD3Q9NYL9 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMOD3Q9NYL9 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMOD3Q9NYL9 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMOD3Q9NYL9 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMOD3Q9NYL9 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMOD3Q9NYL9 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMOD3Q9NYL9 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMOD3Q9NYL9 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMOD3Q9NYL9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMOD3Q9NYL9 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMOD3Q9NYL9 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TMOD3Q9NYL9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TMOD3Q9NYL9 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TMOD3Q9NYL9 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TMOD3Q9NYL9 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TMOD3Q9NYL9 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TMOD3Q9NYL9 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TMOD3Q9NYL9 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
TMOD3Q9NYL9 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMOD3Q9NYL9 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMOD3Q9NYL9 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMOD3Q9NYL9 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMOD3Q9NYL9 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMOD3Q9NYL9 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMOD3Q9NYL9 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMOD3Q9NYL9 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMOD3Q9NYL9 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMOD3Q9NYL9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMOD3Q9NYL9 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMOD3Q9NYL9 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMOD3Q9NYL9 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
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