Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXS3

KLHL28, Kelch-like protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL28Q9NXS3 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLHL28Q9NXS3 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLHL28Q9NXS3 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLHL28Q9NXS3 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLHL28Q9NXS3 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLHL28Q9NXS3 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLHL28Q9NXS3 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
KLHL28Q9NXS3 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLHL28Q9NXS3 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLHL28Q9NXS3 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLHL28Q9NXS3 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLHL28Q9NXS3 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLHL28Q9NXS3 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLHL28Q9NXS3 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLHL28Q9NXS3 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLHL28Q9NXS3 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLHL28Q9NXS3 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL28Q9NXS3 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL28Q9NXS3 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL28Q9NXS3 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL28Q9NXS3 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL28Q9NXS3 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL28Q9NXS3 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL28Q9NXS3 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL28Q9NXS3 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL28Q9NXS3 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL28Q9NXS3 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL28Q9NXS3 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL28Q9NXS3 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL28Q9NXS3 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL28Q9NXS3 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL28Q9NXS3 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL28Q9NXS3 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
KLHL28Q9NXS3 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
KLHL28Q9NXS3 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
KLHL28Q9NXS3 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
KLHL28Q9NXS3 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
KLHL28Q9NXS3 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
KLHL28Q9NXS3 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
KLHL28Q9NXS3 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
KLHL28Q9NXS3 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
KLHL28Q9NXS3 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
KLHL28Q9NXS3 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLHL28Q9NXS3 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
KLHL28Q9NXS3 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLHL28Q9NXS3 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLHL28Q9NXS3 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLHL28Q9NXS3 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
KLHL28Q9NXS3 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLHL28Q9NXS3 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLHL28Q9NXS3 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLHL28Q9NXS3 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLHL28Q9NXS3 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLHL28Q9NXS3 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLHL28Q9NXS3 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLHL28Q9NXS3 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLHL28Q9NXS3 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLHL28Q9NXS3 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLHL28Q9NXS3 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLHL28Q9NXS3 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL28Q9NXS3 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL28Q9NXS3 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL28Q9NXS3 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL28Q9NXS3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL28Q9NXS3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL28Q9NXS3 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL28Q9NXS3 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL28Q9NXS3 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL28Q9NXS3 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL28Q9NXS3 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL28Q9NXS3 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL28Q9NXS3 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL28Q9NXS3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL28Q9NXS3 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL28Q9NXS3 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL28Q9NXS3 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL28Q9NXS3 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL28Q9NXS3 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL28Q9NXS3 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL28Q9NXS3 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL28Q9NXS3 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL28Q9NXS3 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL28Q9NXS3 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL28Q9NXS3 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL28Q9NXS3 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL28Q9NXS3 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL28Q9NXS3 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL28Q9NXS3 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL28Q9NXS3 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL28Q9NXS3 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL28Q9NXS3 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL28Q9NXS3 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL28Q9NXS3 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL28Q9NXS3 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL28Q9NXS3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL28Q9NXS3 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL28Q9NXS3 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL28Q9NXS3 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL28Q9NXS3 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL28Q9NXS3 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms