Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVU0

POLR3E, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC5, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3EQ9NVU0 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLR3EQ9NVU0 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
POLR3EQ9NVU0 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLR3EQ9NVU0 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLR3EQ9NVU0 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLR3EQ9NVU0 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLR3EQ9NVU0 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLR3EQ9NVU0 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLR3EQ9NVU0 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLR3EQ9NVU0 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLR3EQ9NVU0 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
POLR3EQ9NVU0 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
POLR3EQ9NVU0 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
POLR3EQ9NVU0 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
POLR3EQ9NVU0 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
POLR3EQ9NVU0 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
POLR3EQ9NVU0 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
POLR3EQ9NVU0 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
POLR3EQ9NVU0 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
POLR3EQ9NVU0 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
POLR3EQ9NVU0 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
POLR3EQ9NVU0 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
POLR3EQ9NVU0 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
POLR3EQ9NVU0 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
POLR3EQ9NVU0 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
POLR3EQ9NVU0 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
POLR3EQ9NVU0 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
POLR3EQ9NVU0 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR3EQ9NVU0 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR3EQ9NVU0 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR3EQ9NVU0 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR3EQ9NVU0 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR3EQ9NVU0 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR3EQ9NVU0 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR3EQ9NVU0 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR3EQ9NVU0 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR3EQ9NVU0 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR3EQ9NVU0 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR3EQ9NVU0 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR3EQ9NVU0 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLR3EQ9NVU0 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLR3EQ9NVU0 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLR3EQ9NVU0 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLR3EQ9NVU0 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLR3EQ9NVU0 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLR3EQ9NVU0 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLR3EQ9NVU0 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLR3EQ9NVU0 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
POLR3EQ9NVU0 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
POLR3EQ9NVU0 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLR3EQ9NVU0 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLR3EQ9NVU0 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLR3EQ9NVU0 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLR3EQ9NVU0 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLR3EQ9NVU0 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLR3EQ9NVU0 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLR3EQ9NVU0 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLR3EQ9NVU0 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLR3EQ9NVU0 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLR3EQ9NVU0 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLR3EQ9NVU0 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
POLR3EQ9NVU0 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLR3EQ9NVU0 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLR3EQ9NVU0 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLR3EQ9NVU0 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLR3EQ9NVU0 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLR3EQ9NVU0 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
POLR3EQ9NVU0 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLR3EQ9NVU0 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLR3EQ9NVU0 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLR3EQ9NVU0 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLR3EQ9NVU0 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLR3EQ9NVU0 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLR3EQ9NVU0 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLR3EQ9NVU0 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLR3EQ9NVU0 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLR3EQ9NVU0 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLR3EQ9NVU0 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLR3EQ9NVU0 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLR3EQ9NVU0 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
POLR3EQ9NVU0 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLR3EQ9NVU0 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLR3EQ9NVU0 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLR3EQ9NVU0 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLR3EQ9NVU0 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLR3EQ9NVU0 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLR3EQ9NVU0 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLR3EQ9NVU0 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLR3EQ9NVU0 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLR3EQ9NVU0 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLR3EQ9NVU0 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLR3EQ9NVU0 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLR3EQ9NVU0 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLR3EQ9NVU0 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLR3EQ9NVU0 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLR3EQ9NVU0 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLR3EQ9NVU0 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLR3EQ9NVU0 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLR3EQ9NVU0 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLR3EQ9NVU0 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms