Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUV7

SPTLC3, Serine palmitoyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTLC3Q9NUV7 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPTLC3Q9NUV7 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPTLC3Q9NUV7 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPTLC3Q9NUV7 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPTLC3Q9NUV7 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPTLC3Q9NUV7 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPTLC3Q9NUV7 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SPTLC3Q9NUV7 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPTLC3Q9NUV7 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPTLC3Q9NUV7 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPTLC3Q9NUV7 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPTLC3Q9NUV7 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPTLC3Q9NUV7 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPTLC3Q9NUV7 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPTLC3Q9NUV7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPTLC3Q9NUV7 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPTLC3Q9NUV7 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPTLC3Q9NUV7 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPTLC3Q9NUV7 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPTLC3Q9NUV7 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPTLC3Q9NUV7 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPTLC3Q9NUV7 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPTLC3Q9NUV7 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPTLC3Q9NUV7 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPTLC3Q9NUV7 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPTLC3Q9NUV7 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPTLC3Q9NUV7 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPTLC3Q9NUV7 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPTLC3Q9NUV7 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPTLC3Q9NUV7 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPTLC3Q9NUV7 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPTLC3Q9NUV7 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPTLC3Q9NUV7 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPTLC3Q9NUV7 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPTLC3Q9NUV7 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SPTLC3Q9NUV7 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPTLC3Q9NUV7 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SPTLC3Q9NUV7 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPTLC3Q9NUV7 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPTLC3Q9NUV7 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPTLC3Q9NUV7 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPTLC3Q9NUV7 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPTLC3Q9NUV7 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPTLC3Q9NUV7 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPTLC3Q9NUV7 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPTLC3Q9NUV7 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPTLC3Q9NUV7 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPTLC3Q9NUV7 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPTLC3Q9NUV7 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPTLC3Q9NUV7 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPTLC3Q9NUV7 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SPTLC3Q9NUV7 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SPTLC3Q9NUV7 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SPTLC3Q9NUV7 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPTLC3Q9NUV7 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPTLC3Q9NUV7 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPTLC3Q9NUV7 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPTLC3Q9NUV7 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPTLC3Q9NUV7 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPTLC3Q9NUV7 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPTLC3Q9NUV7 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPTLC3Q9NUV7 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPTLC3Q9NUV7 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPTLC3Q9NUV7 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPTLC3Q9NUV7 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPTLC3Q9NUV7 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPTLC3Q9NUV7 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPTLC3Q9NUV7 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPTLC3Q9NUV7 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPTLC3Q9NUV7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPTLC3Q9NUV7 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPTLC3Q9NUV7 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPTLC3Q9NUV7 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPTLC3Q9NUV7 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPTLC3Q9NUV7 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPTLC3Q9NUV7 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPTLC3Q9NUV7 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPTLC3Q9NUV7 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPTLC3Q9NUV7 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPTLC3Q9NUV7 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPTLC3Q9NUV7 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPTLC3Q9NUV7 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPTLC3Q9NUV7 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPTLC3Q9NUV7 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPTLC3Q9NUV7 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPTLC3Q9NUV7 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SPTLC3Q9NUV7 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPTLC3Q9NUV7 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPTLC3Q9NUV7 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPTLC3Q9NUV7 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPTLC3Q9NUV7 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPTLC3Q9NUV7 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SPTLC3Q9NUV7 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPTLC3Q9NUV7 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPTLC3Q9NUV7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPTLC3Q9NUV7 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPTLC3Q9NUV7 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
SPTLC3Q9NUV7 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SPTLC3Q9NUV7 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SPTLC3Q9NUV7 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms