Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUM3

SLC39A9, Zinc transporter ZIP9, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A9Q9NUM3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC39A9Q9NUM3 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC39A9Q9NUM3 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC39A9Q9NUM3 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC39A9Q9NUM3 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC39A9Q9NUM3 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC39A9Q9NUM3 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC39A9Q9NUM3 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC39A9Q9NUM3 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC39A9Q9NUM3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC39A9Q9NUM3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC39A9Q9NUM3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC39A9Q9NUM3 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC39A9Q9NUM3 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC39A9Q9NUM3 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC39A9Q9NUM3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC39A9Q9NUM3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC39A9Q9NUM3 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC39A9Q9NUM3 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC39A9Q9NUM3 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC39A9Q9NUM3 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC39A9Q9NUM3 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC39A9Q9NUM3 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC39A9Q9NUM3 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC39A9Q9NUM3 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC39A9Q9NUM3 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC39A9Q9NUM3 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC39A9Q9NUM3 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC39A9Q9NUM3 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC39A9Q9NUM3 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC39A9Q9NUM3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC39A9Q9NUM3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC39A9Q9NUM3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC39A9Q9NUM3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC39A9Q9NUM3 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC39A9Q9NUM3 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC39A9Q9NUM3 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC39A9Q9NUM3 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC39A9Q9NUM3 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC39A9Q9NUM3 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC39A9Q9NUM3 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC39A9Q9NUM3 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC39A9Q9NUM3 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC39A9Q9NUM3 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC39A9Q9NUM3 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC39A9Q9NUM3 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC39A9Q9NUM3 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC39A9Q9NUM3 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC39A9Q9NUM3 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC39A9Q9NUM3 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC39A9Q9NUM3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC39A9Q9NUM3 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC39A9Q9NUM3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC39A9Q9NUM3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC39A9Q9NUM3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC39A9Q9NUM3 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC39A9Q9NUM3 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC39A9Q9NUM3 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC39A9Q9NUM3 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC39A9Q9NUM3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC39A9Q9NUM3 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC39A9Q9NUM3 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC39A9Q9NUM3 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC39A9Q9NUM3 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC39A9Q9NUM3 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC39A9Q9NUM3 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC39A9Q9NUM3 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC39A9Q9NUM3 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC39A9Q9NUM3 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC39A9Q9NUM3 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC39A9Q9NUM3 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC39A9Q9NUM3 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC39A9Q9NUM3 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC39A9Q9NUM3 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC39A9Q9NUM3 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC39A9Q9NUM3 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC39A9Q9NUM3 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC39A9Q9NUM3 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC39A9Q9NUM3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC39A9Q9NUM3 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC39A9Q9NUM3 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC39A9Q9NUM3 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC39A9Q9NUM3 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC39A9Q9NUM3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC39A9Q9NUM3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC39A9Q9NUM3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC39A9Q9NUM3 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC39A9Q9NUM3 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC39A9Q9NUM3 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC39A9Q9NUM3 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC39A9Q9NUM3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC39A9Q9NUM3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC39A9Q9NUM3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC39A9Q9NUM3 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC39A9Q9NUM3 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC39A9Q9NUM3 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC39A9Q9NUM3 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLC39A9Q9NUM3 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLC39A9Q9NUM3 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLC39A9Q9NUM3 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms