Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ4

TULP4, Tubby-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP4Q9NRJ4 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
TULP4Q9NRJ4 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
TULP4Q9NRJ4 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
TULP4Q9NRJ4 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
TULP4Q9NRJ4 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TULP4Q9NRJ4 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TULP4Q9NRJ4 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TULP4Q9NRJ4 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
TULP4Q9NRJ4 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TULP4Q9NRJ4 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TULP4Q9NRJ4 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TULP4Q9NRJ4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TULP4Q9NRJ4 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TULP4Q9NRJ4 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TULP4Q9NRJ4 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TULP4Q9NRJ4 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
TULP4Q9NRJ4 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TULP4Q9NRJ4 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TULP4Q9NRJ4 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TULP4Q9NRJ4 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TULP4Q9NRJ4 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TULP4Q9NRJ4 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TULP4Q9NRJ4 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TULP4Q9NRJ4 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TULP4Q9NRJ4 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TULP4Q9NRJ4 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TULP4Q9NRJ4 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TULP4Q9NRJ4 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TULP4Q9NRJ4 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TULP4Q9NRJ4 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TULP4Q9NRJ4 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TULP4Q9NRJ4 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
TULP4Q9NRJ4 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TULP4Q9NRJ4 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TULP4Q9NRJ4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TULP4Q9NRJ4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TULP4Q9NRJ4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TULP4Q9NRJ4 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TULP4Q9NRJ4 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TULP4Q9NRJ4 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TULP4Q9NRJ4 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TULP4Q9NRJ4 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
TULP4Q9NRJ4 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TULP4Q9NRJ4 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TULP4Q9NRJ4 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TULP4Q9NRJ4 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TULP4Q9NRJ4 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TULP4Q9NRJ4 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TULP4Q9NRJ4 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TULP4Q9NRJ4 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TULP4Q9NRJ4 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TULP4Q9NRJ4 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TULP4Q9NRJ4 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TULP4Q9NRJ4 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TULP4Q9NRJ4 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TULP4Q9NRJ4 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TULP4Q9NRJ4 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TULP4Q9NRJ4 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
TULP4Q9NRJ4 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
TULP4Q9NRJ4 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TULP4Q9NRJ4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TULP4Q9NRJ4 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TULP4Q9NRJ4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TULP4Q9NRJ4 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TULP4Q9NRJ4 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
TULP4Q9NRJ4 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
TULP4Q9NRJ4 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TULP4Q9NRJ4 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TULP4Q9NRJ4 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
TULP4Q9NRJ4 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TULP4Q9NRJ4 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TULP4Q9NRJ4 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TULP4Q9NRJ4 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TULP4Q9NRJ4 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TULP4Q9NRJ4 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TULP4Q9NRJ4 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TULP4Q9NRJ4 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TULP4Q9NRJ4 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TULP4Q9NRJ4 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TULP4Q9NRJ4 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
TULP4Q9NRJ4 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
TULP4Q9NRJ4 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.21
TULP4Q9NRJ4 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.21
TULP4Q9NRJ4 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.21
TULP4Q9NRJ4 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
TULP4Q9NRJ4 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
TULP4Q9NRJ4 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TULP4Q9NRJ4 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TULP4Q9NRJ4 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TULP4Q9NRJ4 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TULP4Q9NRJ4 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TULP4Q9NRJ4 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TULP4Q9NRJ4 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TULP4Q9NRJ4 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TULP4Q9NRJ4 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TULP4Q9NRJ4 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TULP4Q9NRJ4 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TULP4Q9NRJ4 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TULP4Q9NRJ4 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TULP4Q9NRJ4 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms