Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR80

ARHGEF4, Rho guanine nucleotide exchange factor 4, humanhuman

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Length 690 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF4Q9NR80 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARHGEF4Q9NR80 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ARHGEF4Q9NR80 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARHGEF4Q9NR80 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ARHGEF4Q9NR80 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARHGEF4Q9NR80 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARHGEF4Q9NR80 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ARHGEF4Q9NR80 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARHGEF4Q9NR80 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARHGEF4Q9NR80 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARHGEF4Q9NR80 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARHGEF4Q9NR80 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARHGEF4Q9NR80 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARHGEF4Q9NR80 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARHGEF4Q9NR80 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARHGEF4Q9NR80 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARHGEF4Q9NR80 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARHGEF4Q9NR80 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARHGEF4Q9NR80 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ARHGEF4Q9NR80 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARHGEF4Q9NR80 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARHGEF4Q9NR80 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARHGEF4Q9NR80 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARHGEF4Q9NR80 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARHGEF4Q9NR80 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARHGEF4Q9NR80 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARHGEF4Q9NR80 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARHGEF4Q9NR80 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARHGEF4Q9NR80 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ARHGEF4Q9NR80 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ARHGEF4Q9NR80 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ARHGEF4Q9NR80 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ARHGEF4Q9NR80 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ARHGEF4Q9NR80 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ARHGEF4Q9NR80 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ARHGEF4Q9NR80 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ARHGEF4Q9NR80 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ARHGEF4Q9NR80 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ARHGEF4Q9NR80 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ARHGEF4Q9NR80 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ARHGEF4Q9NR80 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ARHGEF4Q9NR80 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ARHGEF4Q9NR80 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ARHGEF4Q9NR80 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ARHGEF4Q9NR80 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ARHGEF4Q9NR80 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ARHGEF4Q9NR80 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
ARHGEF4Q9NR80 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
ARHGEF4Q9NR80 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ARHGEF4Q9NR80 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ARHGEF4Q9NR80 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ARHGEF4Q9NR80 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ARHGEF4Q9NR80 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ARHGEF4Q9NR80 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ARHGEF4Q9NR80 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ARHGEF4Q9NR80 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ARHGEF4Q9NR80 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ARHGEF4Q9NR80 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ARHGEF4Q9NR80 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ARHGEF4Q9NR80 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ARHGEF4Q9NR80 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ARHGEF4Q9NR80 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ARHGEF4Q9NR80 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ARHGEF4Q9NR80 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ARHGEF4Q9NR80 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ARHGEF4Q9NR80 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ARHGEF4Q9NR80 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ARHGEF4Q9NR80 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ARHGEF4Q9NR80 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ARHGEF4Q9NR80 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ARHGEF4Q9NR80 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ARHGEF4Q9NR80 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ARHGEF4Q9NR80 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ARHGEF4Q9NR80 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ARHGEF4Q9NR80 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ARHGEF4Q9NR80 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ARHGEF4Q9NR80 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ARHGEF4Q9NR80 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ARHGEF4Q9NR80 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ARHGEF4Q9NR80 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ARHGEF4Q9NR80 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARHGEF4Q9NR80 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARHGEF4Q9NR80 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARHGEF4Q9NR80 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARHGEF4Q9NR80 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARHGEF4Q9NR80 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARHGEF4Q9NR80 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARHGEF4Q9NR80 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARHGEF4Q9NR80 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARHGEF4Q9NR80 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARHGEF4Q9NR80 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARHGEF4Q9NR80 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARHGEF4Q9NR80 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ARHGEF4Q9NR80 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARHGEF4Q9NR80 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARHGEF4Q9NR80 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARHGEF4Q9NR80 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARHGEF4Q9NR80 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARHGEF4Q9NR80 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARHGEF4Q9NR80 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
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