Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LHX9Q9NQ69 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
LHX9Q9NQ69 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LHX9Q9NQ69 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
LHX9Q9NQ69 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
LHX9Q9NQ69 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
LHX9Q9NQ69 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
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LHX9Q9NQ69 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LHX9Q9NQ69 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LHX9Q9NQ69 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LHX9Q9NQ69 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LHX9Q9NQ69 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LHX9Q9NQ69 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LHX9Q9NQ69 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LHX9Q9NQ69 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
LHX9Q9NQ69 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
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LHX9Q9NQ69 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
LHX9Q9NQ69 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LHX9Q9NQ69 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LHX9Q9NQ69 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LHX9Q9NQ69 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LHX9Q9NQ69 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LHX9Q9NQ69 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LHX9Q9NQ69 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LHX9Q9NQ69 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LHX9Q9NQ69 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
LHX9Q9NQ69 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LHX9Q9NQ69 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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LHX9Q9NQ69 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LHX9Q9NQ69 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
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LHX9Q9NQ69 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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LHX9Q9NQ69 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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LHX9Q9NQ69 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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LHX9Q9NQ69 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LHX9Q9NQ69 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
LHX9Q9NQ69 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
LHX9Q9NQ69 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LHX9Q9NQ69 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LHX9Q9NQ69 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LHX9Q9NQ69 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
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LHX9Q9NQ69 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LHX9Q9NQ69 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LHX9Q9NQ69 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LHX9Q9NQ69 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LHX9Q9NQ69 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LHX9Q9NQ69 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LHX9Q9NQ69 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LHX9Q9NQ69 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LHX9Q9NQ69 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LHX9Q9NQ69 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LHX9Q9NQ69 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LHX9Q9NQ69 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LHX9Q9NQ69 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LHX9Q9NQ69 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LHX9Q9NQ69 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
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