Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
A4GALTQ9NPC4 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
A4GALTQ9NPC4 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
A4GALTQ9NPC4 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
A4GALTQ9NPC4 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
A4GALTQ9NPC4 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
A4GALTQ9NPC4 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
A4GALTQ9NPC4 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
A4GALTQ9NPC4 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
A4GALTQ9NPC4 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
A4GALTQ9NPC4 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
A4GALTQ9NPC4 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
A4GALTQ9NPC4 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
A4GALTQ9NPC4 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
A4GALTQ9NPC4 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
A4GALTQ9NPC4 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
A4GALTQ9NPC4 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
A4GALTQ9NPC4 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
A4GALTQ9NPC4 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
A4GALTQ9NPC4 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
A4GALTQ9NPC4 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
A4GALTQ9NPC4 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
A4GALTQ9NPC4 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
A4GALTQ9NPC4 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
A4GALTQ9NPC4 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
A4GALTQ9NPC4 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
A4GALTQ9NPC4 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
A4GALTQ9NPC4 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
A4GALTQ9NPC4 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
A4GALTQ9NPC4 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
A4GALTQ9NPC4 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
A4GALTQ9NPC4 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
A4GALTQ9NPC4 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
A4GALTQ9NPC4 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
A4GALTQ9NPC4 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
A4GALTQ9NPC4 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
A4GALTQ9NPC4 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
A4GALTQ9NPC4 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
A4GALTQ9NPC4 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
A4GALTQ9NPC4 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
A4GALTQ9NPC4 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
A4GALTQ9NPC4 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
A4GALTQ9NPC4 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
A4GALTQ9NPC4 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
A4GALTQ9NPC4 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
A4GALTQ9NPC4 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
A4GALTQ9NPC4 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
A4GALTQ9NPC4 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
A4GALTQ9NPC4 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
A4GALTQ9NPC4 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
A4GALTQ9NPC4 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
A4GALTQ9NPC4 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
A4GALTQ9NPC4 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
A4GALTQ9NPC4 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
A4GALTQ9NPC4 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
A4GALTQ9NPC4 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
A4GALTQ9NPC4 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
A4GALTQ9NPC4 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
A4GALTQ9NPC4 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
A4GALTQ9NPC4 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
A4GALTQ9NPC4 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
A4GALTQ9NPC4 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
A4GALTQ9NPC4 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
A4GALTQ9NPC4 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
A4GALTQ9NPC4 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
A4GALTQ9NPC4 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
A4GALTQ9NPC4 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
A4GALTQ9NPC4 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
A4GALTQ9NPC4 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
A4GALTQ9NPC4 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
A4GALTQ9NPC4 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
A4GALTQ9NPC4 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
A4GALTQ9NPC4 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
A4GALTQ9NPC4 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
A4GALTQ9NPC4 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
A4GALTQ9NPC4 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
A4GALTQ9NPC4 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
A4GALTQ9NPC4 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
A4GALTQ9NPC4 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
A4GALTQ9NPC4 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
A4GALTQ9NPC4 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
A4GALTQ9NPC4 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
A4GALTQ9NPC4 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
A4GALTQ9NPC4 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
A4GALTQ9NPC4 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
A4GALTQ9NPC4 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
A4GALTQ9NPC4 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
A4GALTQ9NPC4 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
A4GALTQ9NPC4 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
A4GALTQ9NPC4 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
A4GALTQ9NPC4 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
A4GALTQ9NPC4 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
A4GALTQ9NPC4 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
A4GALTQ9NPC4 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
A4GALTQ9NPC4 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
A4GALTQ9NPC4 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
A4GALTQ9NPC4 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
A4GALTQ9NPC4 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
A4GALTQ9NPC4 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
A4GALTQ9NPC4 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms