Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPA1

KCNMB3, Calcium-activated potassium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB3Q9NPA1 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNMB3Q9NPA1 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNMB3Q9NPA1 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNMB3Q9NPA1 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNMB3Q9NPA1 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNMB3Q9NPA1 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNMB3Q9NPA1 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNMB3Q9NPA1 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNMB3Q9NPA1 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNMB3Q9NPA1 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNMB3Q9NPA1 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNMB3Q9NPA1 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNMB3Q9NPA1 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNMB3Q9NPA1 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNMB3Q9NPA1 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNMB3Q9NPA1 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNMB3Q9NPA1 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNMB3Q9NPA1 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNMB3Q9NPA1 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNMB3Q9NPA1 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNMB3Q9NPA1 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNMB3Q9NPA1 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNMB3Q9NPA1 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNMB3Q9NPA1 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNMB3Q9NPA1 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNMB3Q9NPA1 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNMB3Q9NPA1 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNMB3Q9NPA1 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNMB3Q9NPA1 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNMB3Q9NPA1 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNMB3Q9NPA1 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNMB3Q9NPA1 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNMB3Q9NPA1 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNMB3Q9NPA1 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNMB3Q9NPA1 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNMB3Q9NPA1 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNMB3Q9NPA1 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNMB3Q9NPA1 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNMB3Q9NPA1 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNMB3Q9NPA1 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNMB3Q9NPA1 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNMB3Q9NPA1 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNMB3Q9NPA1 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNMB3Q9NPA1 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNMB3Q9NPA1 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNMB3Q9NPA1 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNMB3Q9NPA1 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNMB3Q9NPA1 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNMB3Q9NPA1 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNMB3Q9NPA1 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNMB3Q9NPA1 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNMB3Q9NPA1 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNMB3Q9NPA1 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNMB3Q9NPA1 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNMB3Q9NPA1 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNMB3Q9NPA1 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNMB3Q9NPA1 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNMB3Q9NPA1 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNMB3Q9NPA1 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNMB3Q9NPA1 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNMB3Q9NPA1 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNMB3Q9NPA1 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNMB3Q9NPA1 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNMB3Q9NPA1 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNMB3Q9NPA1 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNMB3Q9NPA1 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNMB3Q9NPA1 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNMB3Q9NPA1 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNMB3Q9NPA1 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNMB3Q9NPA1 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNMB3Q9NPA1 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNMB3Q9NPA1 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNMB3Q9NPA1 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNMB3Q9NPA1 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNMB3Q9NPA1 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNMB3Q9NPA1 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNMB3Q9NPA1 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNMB3Q9NPA1 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNMB3Q9NPA1 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNMB3Q9NPA1 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
KCNMB3Q9NPA1 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KCNMB3Q9NPA1 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KCNMB3Q9NPA1 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KCNMB3Q9NPA1 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
KCNMB3Q9NPA1 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KCNMB3Q9NPA1 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KCNMB3Q9NPA1 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KCNMB3Q9NPA1 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KCNMB3Q9NPA1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNMB3Q9NPA1 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNMB3Q9NPA1 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNMB3Q9NPA1 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNMB3Q9NPA1 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNMB3Q9NPA1 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNMB3Q9NPA1 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNMB3Q9NPA1 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNMB3Q9NPA1 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNMB3Q9NPA1 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNMB3Q9NPA1 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNMB3Q9NPA1 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms