Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOBEC3GQ9HC16 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOBEC3GQ9HC16 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOBEC3GQ9HC16 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOBEC3GQ9HC16 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOBEC3GQ9HC16 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOBEC3GQ9HC16 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOBEC3GQ9HC16 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOBEC3GQ9HC16 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOBEC3GQ9HC16 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOBEC3GQ9HC16 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOBEC3GQ9HC16 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
APOBEC3GQ9HC16 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOBEC3GQ9HC16 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOBEC3GQ9HC16 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOBEC3GQ9HC16 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOBEC3GQ9HC16 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOBEC3GQ9HC16 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOBEC3GQ9HC16 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOBEC3GQ9HC16 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOBEC3GQ9HC16 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOBEC3GQ9HC16 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOBEC3GQ9HC16 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOBEC3GQ9HC16 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOBEC3GQ9HC16 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOBEC3GQ9HC16 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
APOBEC3GQ9HC16 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOBEC3GQ9HC16 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOBEC3GQ9HC16 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOBEC3GQ9HC16 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
APOBEC3GQ9HC16 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOBEC3GQ9HC16 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOBEC3GQ9HC16 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOBEC3GQ9HC16 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOBEC3GQ9HC16 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOBEC3GQ9HC16 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOBEC3GQ9HC16 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
APOBEC3GQ9HC16 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOBEC3GQ9HC16 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOBEC3GQ9HC16 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOBEC3GQ9HC16 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOBEC3GQ9HC16 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
APOBEC3GQ9HC16 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOBEC3GQ9HC16 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOBEC3GQ9HC16 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOBEC3GQ9HC16 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOBEC3GQ9HC16 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOBEC3GQ9HC16 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOBEC3GQ9HC16 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOBEC3GQ9HC16 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOBEC3GQ9HC16 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOBEC3GQ9HC16 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOBEC3GQ9HC16 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOBEC3GQ9HC16 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOBEC3GQ9HC16 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOBEC3GQ9HC16 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOBEC3GQ9HC16 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOBEC3GQ9HC16 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOBEC3GQ9HC16 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOBEC3GQ9HC16 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOBEC3GQ9HC16 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOBEC3GQ9HC16 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOBEC3GQ9HC16 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOBEC3GQ9HC16 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOBEC3GQ9HC16 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOBEC3GQ9HC16 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOBEC3GQ9HC16 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOBEC3GQ9HC16 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOBEC3GQ9HC16 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOBEC3GQ9HC16 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOBEC3GQ9HC16 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOBEC3GQ9HC16 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOBEC3GQ9HC16 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOBEC3GQ9HC16 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOBEC3GQ9HC16 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOBEC3GQ9HC16 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOBEC3GQ9HC16 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOBEC3GQ9HC16 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOBEC3GQ9HC16 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOBEC3GQ9HC16 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOBEC3GQ9HC16 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOBEC3GQ9HC16 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOBEC3GQ9HC16 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOBEC3GQ9HC16 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOBEC3GQ9HC16 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOBEC3GQ9HC16 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOBEC3GQ9HC16 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOBEC3GQ9HC16 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOBEC3GQ9HC16 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOBEC3GQ9HC16 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOBEC3GQ9HC16 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOBEC3GQ9HC16 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOBEC3GQ9HC16 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOBEC3GQ9HC16 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOBEC3GQ9HC16 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOBEC3GQ9HC16 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOBEC3GQ9HC16 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
APOBEC3GQ9HC16 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOBEC3GQ9HC16 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOBEC3GQ9HC16 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms