Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBG7

LY9, T-lymphocyte surface antigen Ly-9, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LY9Q9HBG7 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LY9Q9HBG7 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LY9Q9HBG7 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LY9Q9HBG7 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LY9Q9HBG7 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LY9Q9HBG7 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LY9Q9HBG7 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
LY9Q9HBG7 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
LY9Q9HBG7 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
LY9Q9HBG7 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LY9Q9HBG7 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LY9Q9HBG7 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LY9Q9HBG7 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LY9Q9HBG7 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LY9Q9HBG7 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LY9Q9HBG7 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LY9Q9HBG7 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LY9Q9HBG7 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LY9Q9HBG7 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LY9Q9HBG7 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
LY9Q9HBG7 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LY9Q9HBG7 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LY9Q9HBG7 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LY9Q9HBG7 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LY9Q9HBG7 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LY9Q9HBG7 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LY9Q9HBG7 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LY9Q9HBG7 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LY9Q9HBG7 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LY9Q9HBG7 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LY9Q9HBG7 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LY9Q9HBG7 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LY9Q9HBG7 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LY9Q9HBG7 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LY9Q9HBG7 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LY9Q9HBG7 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LY9Q9HBG7 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LY9Q9HBG7 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
LY9Q9HBG7 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LY9Q9HBG7 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LY9Q9HBG7 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
LY9Q9HBG7 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
LY9Q9HBG7 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LY9Q9HBG7 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LY9Q9HBG7 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LY9Q9HBG7 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LY9Q9HBG7 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LY9Q9HBG7 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LY9Q9HBG7 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
LY9Q9HBG7 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
LY9Q9HBG7 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
LY9Q9HBG7 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LY9Q9HBG7 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LY9Q9HBG7 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LY9Q9HBG7 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LY9Q9HBG7 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LY9Q9HBG7 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LY9Q9HBG7 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LY9Q9HBG7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LY9Q9HBG7 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
LY9Q9HBG7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LY9Q9HBG7 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LY9Q9HBG7 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LY9Q9HBG7 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LY9Q9HBG7 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LY9Q9HBG7 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LY9Q9HBG7 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LY9Q9HBG7 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LY9Q9HBG7 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LY9Q9HBG7 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LY9Q9HBG7 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LY9Q9HBG7 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LY9Q9HBG7 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LY9Q9HBG7 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LY9Q9HBG7 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LY9Q9HBG7 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LY9Q9HBG7 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LY9Q9HBG7 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LY9Q9HBG7 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LY9Q9HBG7 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LY9Q9HBG7 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LY9Q9HBG7 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LY9Q9HBG7 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LY9Q9HBG7 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LY9Q9HBG7 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LY9Q9HBG7 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LY9Q9HBG7 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LY9Q9HBG7 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LY9Q9HBG7 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LY9Q9HBG7 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LY9Q9HBG7 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LY9Q9HBG7 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LY9Q9HBG7 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LY9Q9HBG7 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LY9Q9HBG7 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LY9Q9HBG7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LY9Q9HBG7 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LY9Q9HBG7 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LY9Q9HBG7 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LY9Q9HBG7 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms