Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7L9

SUDS3, Sin3 histone deacetylase corepressor complex component SDS3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUDS3Q9H7L9 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SUDS3Q9H7L9 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SUDS3Q9H7L9 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SUDS3Q9H7L9 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SUDS3Q9H7L9 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SUDS3Q9H7L9 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SUDS3Q9H7L9 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SUDS3Q9H7L9 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SUDS3Q9H7L9 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SUDS3Q9H7L9 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SUDS3Q9H7L9 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SUDS3Q9H7L9 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SUDS3Q9H7L9 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SUDS3Q9H7L9 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SUDS3Q9H7L9 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SUDS3Q9H7L9 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SUDS3Q9H7L9 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SUDS3Q9H7L9 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SUDS3Q9H7L9 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SUDS3Q9H7L9 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SUDS3Q9H7L9 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SUDS3Q9H7L9 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SUDS3Q9H7L9 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SUDS3Q9H7L9 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SUDS3Q9H7L9 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SUDS3Q9H7L9 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SUDS3Q9H7L9 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SUDS3Q9H7L9 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SUDS3Q9H7L9 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SUDS3Q9H7L9 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SUDS3Q9H7L9 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SUDS3Q9H7L9 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SUDS3Q9H7L9 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SUDS3Q9H7L9 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SUDS3Q9H7L9 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SUDS3Q9H7L9 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SUDS3Q9H7L9 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SUDS3Q9H7L9 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SUDS3Q9H7L9 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SUDS3Q9H7L9 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SUDS3Q9H7L9 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SUDS3Q9H7L9 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SUDS3Q9H7L9 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SUDS3Q9H7L9 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SUDS3Q9H7L9 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SUDS3Q9H7L9 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SUDS3Q9H7L9 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SUDS3Q9H7L9 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SUDS3Q9H7L9 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SUDS3Q9H7L9 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SUDS3Q9H7L9 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SUDS3Q9H7L9 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SUDS3Q9H7L9 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SUDS3Q9H7L9 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SUDS3Q9H7L9 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SUDS3Q9H7L9 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SUDS3Q9H7L9 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SUDS3Q9H7L9 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SUDS3Q9H7L9 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SUDS3Q9H7L9 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SUDS3Q9H7L9 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SUDS3Q9H7L9 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SUDS3Q9H7L9 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SUDS3Q9H7L9 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SUDS3Q9H7L9 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SUDS3Q9H7L9 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SUDS3Q9H7L9 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SUDS3Q9H7L9 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SUDS3Q9H7L9 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SUDS3Q9H7L9 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SUDS3Q9H7L9 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SUDS3Q9H7L9 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SUDS3Q9H7L9 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SUDS3Q9H7L9 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SUDS3Q9H7L9 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SUDS3Q9H7L9 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SUDS3Q9H7L9 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SUDS3Q9H7L9 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SUDS3Q9H7L9 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SUDS3Q9H7L9 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SUDS3Q9H7L9 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SUDS3Q9H7L9 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SUDS3Q9H7L9 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SUDS3Q9H7L9 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SUDS3Q9H7L9 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SUDS3Q9H7L9 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SUDS3Q9H7L9 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SUDS3Q9H7L9 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SUDS3Q9H7L9 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SUDS3Q9H7L9 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SUDS3Q9H7L9 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SUDS3Q9H7L9 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SUDS3Q9H7L9 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SUDS3Q9H7L9 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SUDS3Q9H7L9 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SUDS3Q9H7L9 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SUDS3Q9H7L9 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SUDS3Q9H7L9 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SUDS3Q9H7L9 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SUDS3Q9H7L9 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms