Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2J1

ARRDC1-AS1, Uncharacterized protein ARRDC1-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARRDC1-AS1Q9H2J1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARRDC1-AS1Q9H2J1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARRDC1-AS1Q9H2J1 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARRDC1-AS1Q9H2J1 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARRDC1-AS1Q9H2J1 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ARRDC1-AS1Q9H2J1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARRDC1-AS1Q9H2J1 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARRDC1-AS1Q9H2J1 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ARRDC1-AS1Q9H2J1 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARRDC1-AS1Q9H2J1 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ARRDC1-AS1Q9H2J1 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ARRDC1-AS1Q9H2J1 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARRDC1-AS1Q9H2J1 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARRDC1-AS1Q9H2J1 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ARRDC1-AS1Q9H2J1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARRDC1-AS1Q9H2J1 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARRDC1-AS1Q9H2J1 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARRDC1-AS1Q9H2J1 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARRDC1-AS1Q9H2J1 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARRDC1-AS1Q9H2J1 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARRDC1-AS1Q9H2J1 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARRDC1-AS1Q9H2J1 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARRDC1-AS1Q9H2J1 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARRDC1-AS1Q9H2J1 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARRDC1-AS1Q9H2J1 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ARRDC1-AS1Q9H2J1 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARRDC1-AS1Q9H2J1 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARRDC1-AS1Q9H2J1 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ARRDC1-AS1Q9H2J1 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARRDC1-AS1Q9H2J1 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ARRDC1-AS1Q9H2J1 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARRDC1-AS1Q9H2J1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARRDC1-AS1Q9H2J1 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARRDC1-AS1Q9H2J1 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ARRDC1-AS1Q9H2J1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARRDC1-AS1Q9H2J1 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARRDC1-AS1Q9H2J1 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARRDC1-AS1Q9H2J1 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARRDC1-AS1Q9H2J1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARRDC1-AS1Q9H2J1 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARRDC1-AS1Q9H2J1 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARRDC1-AS1Q9H2J1 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARRDC1-AS1Q9H2J1 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARRDC1-AS1Q9H2J1 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARRDC1-AS1Q9H2J1 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARRDC1-AS1Q9H2J1 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARRDC1-AS1Q9H2J1 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARRDC1-AS1Q9H2J1 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARRDC1-AS1Q9H2J1 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ARRDC1-AS1Q9H2J1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARRDC1-AS1Q9H2J1 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARRDC1-AS1Q9H2J1 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARRDC1-AS1Q9H2J1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARRDC1-AS1Q9H2J1 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARRDC1-AS1Q9H2J1 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARRDC1-AS1Q9H2J1 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARRDC1-AS1Q9H2J1 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARRDC1-AS1Q9H2J1 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARRDC1-AS1Q9H2J1 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARRDC1-AS1Q9H2J1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARRDC1-AS1Q9H2J1 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARRDC1-AS1Q9H2J1 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARRDC1-AS1Q9H2J1 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARRDC1-AS1Q9H2J1 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARRDC1-AS1Q9H2J1 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ARRDC1-AS1Q9H2J1 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARRDC1-AS1Q9H2J1 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARRDC1-AS1Q9H2J1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARRDC1-AS1Q9H2J1 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARRDC1-AS1Q9H2J1 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARRDC1-AS1Q9H2J1 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARRDC1-AS1Q9H2J1 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ARRDC1-AS1Q9H2J1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARRDC1-AS1Q9H2J1 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARRDC1-AS1Q9H2J1 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARRDC1-AS1Q9H2J1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARRDC1-AS1Q9H2J1 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARRDC1-AS1Q9H2J1 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARRDC1-AS1Q9H2J1 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ARRDC1-AS1Q9H2J1 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARRDC1-AS1Q9H2J1 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARRDC1-AS1Q9H2J1 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ARRDC1-AS1Q9H2J1 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARRDC1-AS1Q9H2J1 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARRDC1-AS1Q9H2J1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARRDC1-AS1Q9H2J1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARRDC1-AS1Q9H2J1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARRDC1-AS1Q9H2J1 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARRDC1-AS1Q9H2J1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARRDC1-AS1Q9H2J1 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARRDC1-AS1Q9H2J1 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARRDC1-AS1Q9H2J1 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ARRDC1-AS1Q9H2J1 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARRDC1-AS1Q9H2J1 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARRDC1-AS1Q9H2J1 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARRDC1-AS1Q9H2J1 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARRDC1-AS1Q9H2J1 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ARRDC1-AS1Q9H2J1 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARRDC1-AS1Q9H2J1 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARRDC1-AS1Q9H2J1 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms