Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU3

TMEM39B, Transmembrane protein 39B, humanhuman

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM39BQ9GZU3 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMEM39BQ9GZU3 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMEM39BQ9GZU3 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMEM39BQ9GZU3 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMEM39BQ9GZU3 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMEM39BQ9GZU3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TMEM39BQ9GZU3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TMEM39BQ9GZU3 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TMEM39BQ9GZU3 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TMEM39BQ9GZU3 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM39BQ9GZU3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM39BQ9GZU3 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM39BQ9GZU3 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM39BQ9GZU3 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM39BQ9GZU3 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM39BQ9GZU3 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM39BQ9GZU3 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM39BQ9GZU3 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM39BQ9GZU3 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM39BQ9GZU3 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM39BQ9GZU3 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM39BQ9GZU3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM39BQ9GZU3 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM39BQ9GZU3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM39BQ9GZU3 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM39BQ9GZU3 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM39BQ9GZU3 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM39BQ9GZU3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM39BQ9GZU3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM39BQ9GZU3 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM39BQ9GZU3 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM39BQ9GZU3 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM39BQ9GZU3 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM39BQ9GZU3 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM39BQ9GZU3 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM39BQ9GZU3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM39BQ9GZU3 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM39BQ9GZU3 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM39BQ9GZU3 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM39BQ9GZU3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM39BQ9GZU3 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM39BQ9GZU3 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM39BQ9GZU3 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM39BQ9GZU3 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM39BQ9GZU3 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM39BQ9GZU3 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM39BQ9GZU3 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM39BQ9GZU3 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM39BQ9GZU3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM39BQ9GZU3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM39BQ9GZU3 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM39BQ9GZU3 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM39BQ9GZU3 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM39BQ9GZU3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM39BQ9GZU3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM39BQ9GZU3 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM39BQ9GZU3 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM39BQ9GZU3 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM39BQ9GZU3 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM39BQ9GZU3 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM39BQ9GZU3 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM39BQ9GZU3 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM39BQ9GZU3 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM39BQ9GZU3 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM39BQ9GZU3 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM39BQ9GZU3 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM39BQ9GZU3 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM39BQ9GZU3 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM39BQ9GZU3 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM39BQ9GZU3 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM39BQ9GZU3 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM39BQ9GZU3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM39BQ9GZU3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM39BQ9GZU3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM39BQ9GZU3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM39BQ9GZU3 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM39BQ9GZU3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM39BQ9GZU3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM39BQ9GZU3 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM39BQ9GZU3 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM39BQ9GZU3 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM39BQ9GZU3 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM39BQ9GZU3 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM39BQ9GZU3 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM39BQ9GZU3 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM39BQ9GZU3 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM39BQ9GZU3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM39BQ9GZU3 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM39BQ9GZU3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM39BQ9GZU3 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM39BQ9GZU3 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM39BQ9GZU3 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM39BQ9GZU3 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM39BQ9GZU3 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM39BQ9GZU3 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM39BQ9GZU3 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM39BQ9GZU3 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM39BQ9GZU3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM39BQ9GZU3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM39BQ9GZU3 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms