Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J8

WDR33, pre-mRNA 3' end processing protein WDR33, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR33Q9C0J8 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
WDR33Q9C0J8 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
WDR33Q9C0J8 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
WDR33Q9C0J8 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
WDR33Q9C0J8 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
WDR33Q9C0J8 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
WDR33Q9C0J8 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
WDR33Q9C0J8 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
WDR33Q9C0J8 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
WDR33Q9C0J8 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
WDR33Q9C0J8 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
WDR33Q9C0J8 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
WDR33Q9C0J8 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
WDR33Q9C0J8 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
WDR33Q9C0J8 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
WDR33Q9C0J8 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
WDR33Q9C0J8 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
WDR33Q9C0J8 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
WDR33Q9C0J8 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
WDR33Q9C0J8 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
WDR33Q9C0J8 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
WDR33Q9C0J8 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
WDR33Q9C0J8 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
WDR33Q9C0J8 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
WDR33Q9C0J8 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
WDR33Q9C0J8 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
WDR33Q9C0J8 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
WDR33Q9C0J8 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
WDR33Q9C0J8 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
WDR33Q9C0J8 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
WDR33Q9C0J8 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
WDR33Q9C0J8 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
WDR33Q9C0J8 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
WDR33Q9C0J8 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
WDR33Q9C0J8 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
WDR33Q9C0J8 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
WDR33Q9C0J8 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
WDR33Q9C0J8 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
WDR33Q9C0J8 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
WDR33Q9C0J8 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
WDR33Q9C0J8 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
WDR33Q9C0J8 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
WDR33Q9C0J8 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
WDR33Q9C0J8 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
WDR33Q9C0J8 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
WDR33Q9C0J8 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
WDR33Q9C0J8 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
WDR33Q9C0J8 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
WDR33Q9C0J8 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
WDR33Q9C0J8 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
WDR33Q9C0J8 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
WDR33Q9C0J8 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
WDR33Q9C0J8 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
WDR33Q9C0J8 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
WDR33Q9C0J8 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
WDR33Q9C0J8 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
WDR33Q9C0J8 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
WDR33Q9C0J8 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
WDR33Q9C0J8 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
WDR33Q9C0J8 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
WDR33Q9C0J8 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
WDR33Q9C0J8 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
WDR33Q9C0J8 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
WDR33Q9C0J8 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
WDR33Q9C0J8 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
WDR33Q9C0J8 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
WDR33Q9C0J8 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
WDR33Q9C0J8 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
WDR33Q9C0J8 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
WDR33Q9C0J8 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
WDR33Q9C0J8 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
WDR33Q9C0J8 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
WDR33Q9C0J8 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
WDR33Q9C0J8 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
WDR33Q9C0J8 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
WDR33Q9C0J8 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
WDR33Q9C0J8 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
WDR33Q9C0J8 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
WDR33Q9C0J8 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
WDR33Q9C0J8 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
WDR33Q9C0J8 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
WDR33Q9C0J8 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
WDR33Q9C0J8 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
WDR33Q9C0J8 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
WDR33Q9C0J8 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
WDR33Q9C0J8 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
WDR33Q9C0J8 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
WDR33Q9C0J8 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
WDR33Q9C0J8 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
WDR33Q9C0J8 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
WDR33Q9C0J8 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
WDR33Q9C0J8 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
WDR33Q9C0J8 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
WDR33Q9C0J8 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
WDR33Q9C0J8 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
WDR33Q9C0J8 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
WDR33Q9C0J8 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
WDR33Q9C0J8 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
WDR33Q9C0J8 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
WDR33Q9C0J8 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms