Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM54Q9BYV2 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM54Q9BYV2 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM54Q9BYV2 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM54Q9BYV2 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM54Q9BYV2 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM54Q9BYV2 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM54Q9BYV2 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM54Q9BYV2 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM54Q9BYV2 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM54Q9BYV2 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM54Q9BYV2 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM54Q9BYV2 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM54Q9BYV2 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM54Q9BYV2 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM54Q9BYV2 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM54Q9BYV2 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM54Q9BYV2 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM54Q9BYV2 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM54Q9BYV2 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM54Q9BYV2 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM54Q9BYV2 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM54Q9BYV2 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM54Q9BYV2 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM54Q9BYV2 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM54Q9BYV2 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM54Q9BYV2 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM54Q9BYV2 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM54Q9BYV2 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM54Q9BYV2 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM54Q9BYV2 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM54Q9BYV2 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM54Q9BYV2 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM54Q9BYV2 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM54Q9BYV2 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM54Q9BYV2 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM54Q9BYV2 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM54Q9BYV2 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM54Q9BYV2 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM54Q9BYV2 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM54Q9BYV2 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM54Q9BYV2 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM54Q9BYV2 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM54Q9BYV2 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM54Q9BYV2 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM54Q9BYV2 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIM54Q9BYV2 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIM54Q9BYV2 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIM54Q9BYV2 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIM54Q9BYV2 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIM54Q9BYV2 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIM54Q9BYV2 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIM54Q9BYV2 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIM54Q9BYV2 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIM54Q9BYV2 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIM54Q9BYV2 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIM54Q9BYV2 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIM54Q9BYV2 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIM54Q9BYV2 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIM54Q9BYV2 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIM54Q9BYV2 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIM54Q9BYV2 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM54Q9BYV2 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM54Q9BYV2 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM54Q9BYV2 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM54Q9BYV2 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM54Q9BYV2 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM54Q9BYV2 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM54Q9BYV2 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM54Q9BYV2 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM54Q9BYV2 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM54Q9BYV2 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM54Q9BYV2 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM54Q9BYV2 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM54Q9BYV2 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM54Q9BYV2 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM54Q9BYV2 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM54Q9BYV2 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM54Q9BYV2 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM54Q9BYV2 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM54Q9BYV2 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM54Q9BYV2 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM54Q9BYV2 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM54Q9BYV2 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM54Q9BYV2 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM54Q9BYV2 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM54Q9BYV2 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM54Q9BYV2 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM54Q9BYV2 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM54Q9BYV2 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM54Q9BYV2 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM54Q9BYV2 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM54Q9BYV2 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM54Q9BYV2 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM54Q9BYV2 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM54Q9BYV2 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM54Q9BYV2 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM54Q9BYV2 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM54Q9BYV2 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM54Q9BYV2 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms