Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC4A5Q9BY07 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC4A5Q9BY07 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC4A5Q9BY07 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC4A5Q9BY07 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC4A5Q9BY07 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC4A5Q9BY07 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC4A5Q9BY07 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC4A5Q9BY07 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC4A5Q9BY07 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC4A5Q9BY07 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC4A5Q9BY07 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC4A5Q9BY07 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC4A5Q9BY07 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC4A5Q9BY07 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC4A5Q9BY07 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC4A5Q9BY07 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC4A5Q9BY07 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC4A5Q9BY07 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC4A5Q9BY07 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC4A5Q9BY07 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC4A5Q9BY07 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC4A5Q9BY07 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC4A5Q9BY07 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC4A5Q9BY07 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC4A5Q9BY07 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC4A5Q9BY07 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC4A5Q9BY07 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC4A5Q9BY07 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC4A5Q9BY07 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC4A5Q9BY07 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC4A5Q9BY07 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC4A5Q9BY07 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC4A5Q9BY07 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC4A5Q9BY07 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC4A5Q9BY07 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC4A5Q9BY07 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC4A5Q9BY07 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC4A5Q9BY07 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC4A5Q9BY07 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC4A5Q9BY07 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC4A5Q9BY07 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC4A5Q9BY07 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC4A5Q9BY07 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC4A5Q9BY07 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC4A5Q9BY07 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC4A5Q9BY07 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC4A5Q9BY07 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC4A5Q9BY07 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC4A5Q9BY07 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC4A5Q9BY07 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC4A5Q9BY07 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC4A5Q9BY07 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC4A5Q9BY07 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC4A5Q9BY07 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC4A5Q9BY07 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC4A5Q9BY07 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC4A5Q9BY07 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC4A5Q9BY07 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC4A5Q9BY07 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC4A5Q9BY07 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC4A5Q9BY07 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC4A5Q9BY07 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC4A5Q9BY07 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC4A5Q9BY07 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC4A5Q9BY07 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC4A5Q9BY07 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC4A5Q9BY07 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC4A5Q9BY07 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC4A5Q9BY07 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC4A5Q9BY07 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC4A5Q9BY07 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC4A5Q9BY07 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC4A5Q9BY07 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC4A5Q9BY07 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC4A5Q9BY07 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC4A5Q9BY07 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC4A5Q9BY07 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC4A5Q9BY07 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC4A5Q9BY07 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC4A5Q9BY07 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC4A5Q9BY07 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC4A5Q9BY07 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC4A5Q9BY07 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC4A5Q9BY07 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC4A5Q9BY07 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC4A5Q9BY07 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLC4A5Q9BY07 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLC4A5Q9BY07 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLC4A5Q9BY07 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC4A5Q9BY07 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC4A5Q9BY07 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC4A5Q9BY07 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC4A5Q9BY07 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC4A5Q9BY07 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC4A5Q9BY07 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC4A5Q9BY07 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC4A5Q9BY07 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC4A5Q9BY07 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC4A5Q9BY07 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms