Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
RNF17Q9BXT8 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
RNF17Q9BXT8 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
RNF17Q9BXT8 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
RNF17Q9BXT8 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
RNF17Q9BXT8 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
RNF17Q9BXT8 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
RNF17Q9BXT8 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
RNF17Q9BXT8 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
RNF17Q9BXT8 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
RNF17Q9BXT8 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
RNF17Q9BXT8 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
RNF17Q9BXT8 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
RNF17Q9BXT8 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
RNF17Q9BXT8 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
RNF17Q9BXT8 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
RNF17Q9BXT8 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
RNF17Q9BXT8 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
RNF17Q9BXT8 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
RNF17Q9BXT8 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
RNF17Q9BXT8 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
RNF17Q9BXT8 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
RNF17Q9BXT8 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
RNF17Q9BXT8 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
RNF17Q9BXT8 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
RNF17Q9BXT8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
RNF17Q9BXT8 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
RNF17Q9BXT8 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
RNF17Q9BXT8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
RNF17Q9BXT8 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
RNF17Q9BXT8 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
RNF17Q9BXT8 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
RNF17Q9BXT8 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
RNF17Q9BXT8 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
RNF17Q9BXT8 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
RNF17Q9BXT8 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
RNF17Q9BXT8 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
RNF17Q9BXT8 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
RNF17Q9BXT8 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
RNF17Q9BXT8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
RNF17Q9BXT8 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
RNF17Q9BXT8 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
RNF17Q9BXT8 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC30.71■■■□□ 2.51
RNF17Q9BXT8 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
RNF17Q9BXT8 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC30.71■■■□□ 2.51
RNF17Q9BXT8 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
RNF17Q9BXT8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
RNF17Q9BXT8 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
RNF17Q9BXT8 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
RNF17Q9BXT8 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
RNF17Q9BXT8 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
RNF17Q9BXT8 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
RNF17Q9BXT8 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
RNF17Q9BXT8 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
RNF17Q9BXT8 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.5
RNF17Q9BXT8 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.5
RNF17Q9BXT8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
RNF17Q9BXT8 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
RNF17Q9BXT8 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC30.69■■■□□ 2.5
RNF17Q9BXT8 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC30.69■■■□□ 2.5
RNF17Q9BXT8 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
RNF17Q9BXT8 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
RNF17Q9BXT8 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
RNF17Q9BXT8 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
RNF17Q9BXT8 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
RNF17Q9BXT8 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
RNF17Q9BXT8 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
RNF17Q9BXT8 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
RNF17Q9BXT8 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
RNF17Q9BXT8 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
RNF17Q9BXT8 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
RNF17Q9BXT8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
RNF17Q9BXT8 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
RNF17Q9BXT8 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
RNF17Q9BXT8 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.68■■■□□ 2.5
RNF17Q9BXT8 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC30.68■■■□□ 2.5
RNF17Q9BXT8 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
RNF17Q9BXT8 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
RNF17Q9BXT8 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
RNF17Q9BXT8 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
RNF17Q9BXT8 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
RNF17Q9BXT8 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
RNF17Q9BXT8 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC30.68■■■□□ 2.5
RNF17Q9BXT8 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
RNF17Q9BXT8 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
RNF17Q9BXT8 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
RNF17Q9BXT8 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
RNF17Q9BXT8 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
RNF17Q9BXT8 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
RNF17Q9BXT8 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
RNF17Q9BXT8 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
RNF17Q9BXT8 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
RNF17Q9BXT8 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
RNF17Q9BXT8 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
RNF17Q9BXT8 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
RNF17Q9BXT8 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
RNF17Q9BXT8 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
RNF17Q9BXT8 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
RNF17Q9BXT8 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
RNF17Q9BXT8 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms