Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
BRIP1Q9BX63 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
BRIP1Q9BX63 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
BRIP1Q9BX63 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
BRIP1Q9BX63 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BRIP1Q9BX63 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BRIP1Q9BX63 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
BRIP1Q9BX63 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
BRIP1Q9BX63 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BRIP1Q9BX63 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BRIP1Q9BX63 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BRIP1Q9BX63 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BRIP1Q9BX63 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
BRIP1Q9BX63 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BRIP1Q9BX63 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
BRIP1Q9BX63 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
BRIP1Q9BX63 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
BRIP1Q9BX63 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
BRIP1Q9BX63 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BRIP1Q9BX63 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
BRIP1Q9BX63 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BRIP1Q9BX63 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
BRIP1Q9BX63 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
BRIP1Q9BX63 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BRIP1Q9BX63 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
BRIP1Q9BX63 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
BRIP1Q9BX63 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BRIP1Q9BX63 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BRIP1Q9BX63 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BRIP1Q9BX63 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BRIP1Q9BX63 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
BRIP1Q9BX63 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BRIP1Q9BX63 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
BRIP1Q9BX63 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
BRIP1Q9BX63 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BRIP1Q9BX63 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BRIP1Q9BX63 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BRIP1Q9BX63 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
BRIP1Q9BX63 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
BRIP1Q9BX63 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
BRIP1Q9BX63 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
BRIP1Q9BX63 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
BRIP1Q9BX63 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BRIP1Q9BX63 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
BRIP1Q9BX63 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
BRIP1Q9BX63 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
BRIP1Q9BX63 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BRIP1Q9BX63 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
BRIP1Q9BX63 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
BRIP1Q9BX63 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BRIP1Q9BX63 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
BRIP1Q9BX63 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BRIP1Q9BX63 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
BRIP1Q9BX63 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
BRIP1Q9BX63 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BRIP1Q9BX63 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
BRIP1Q9BX63 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BRIP1Q9BX63 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BRIP1Q9BX63 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
BRIP1Q9BX63 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BRIP1Q9BX63 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
BRIP1Q9BX63 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
BRIP1Q9BX63 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
BRIP1Q9BX63 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
BRIP1Q9BX63 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BRIP1Q9BX63 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BRIP1Q9BX63 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BRIP1Q9BX63 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BRIP1Q9BX63 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BRIP1Q9BX63 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BRIP1Q9BX63 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BRIP1Q9BX63 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BRIP1Q9BX63 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BRIP1Q9BX63 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BRIP1Q9BX63 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BRIP1Q9BX63 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
BRIP1Q9BX63 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BRIP1Q9BX63 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BRIP1Q9BX63 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BRIP1Q9BX63 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BRIP1Q9BX63 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
BRIP1Q9BX63 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
BRIP1Q9BX63 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
BRIP1Q9BX63 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
BRIP1Q9BX63 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
BRIP1Q9BX63 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
BRIP1Q9BX63 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
BRIP1Q9BX63 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
BRIP1Q9BX63 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
BRIP1Q9BX63 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
BRIP1Q9BX63 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
BRIP1Q9BX63 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
BRIP1Q9BX63 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
BRIP1Q9BX63 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
BRIP1Q9BX63 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
BRIP1Q9BX63 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
BRIP1Q9BX63 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BRIP1Q9BX63 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BRIP1Q9BX63 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
BRIP1Q9BX63 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms