Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU61

NDUFAF3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAF3Q9BU61 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDUFAF3Q9BU61 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDUFAF3Q9BU61 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDUFAF3Q9BU61 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDUFAF3Q9BU61 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDUFAF3Q9BU61 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDUFAF3Q9BU61 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NDUFAF3Q9BU61 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDUFAF3Q9BU61 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDUFAF3Q9BU61 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDUFAF3Q9BU61 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDUFAF3Q9BU61 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDUFAF3Q9BU61 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDUFAF3Q9BU61 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDUFAF3Q9BU61 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDUFAF3Q9BU61 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDUFAF3Q9BU61 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDUFAF3Q9BU61 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDUFAF3Q9BU61 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDUFAF3Q9BU61 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDUFAF3Q9BU61 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDUFAF3Q9BU61 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDUFAF3Q9BU61 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDUFAF3Q9BU61 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDUFAF3Q9BU61 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFAF3Q9BU61 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFAF3Q9BU61 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFAF3Q9BU61 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFAF3Q9BU61 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFAF3Q9BU61 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFAF3Q9BU61 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFAF3Q9BU61 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFAF3Q9BU61 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFAF3Q9BU61 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFAF3Q9BU61 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFAF3Q9BU61 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFAF3Q9BU61 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFAF3Q9BU61 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFAF3Q9BU61 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFAF3Q9BU61 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFAF3Q9BU61 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFAF3Q9BU61 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFAF3Q9BU61 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFAF3Q9BU61 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFAF3Q9BU61 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFAF3Q9BU61 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFAF3Q9BU61 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFAF3Q9BU61 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFAF3Q9BU61 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFAF3Q9BU61 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFAF3Q9BU61 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFAF3Q9BU61 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFAF3Q9BU61 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFAF3Q9BU61 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFAF3Q9BU61 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFAF3Q9BU61 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFAF3Q9BU61 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFAF3Q9BU61 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFAF3Q9BU61 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFAF3Q9BU61 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFAF3Q9BU61 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFAF3Q9BU61 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFAF3Q9BU61 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFAF3Q9BU61 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFAF3Q9BU61 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFAF3Q9BU61 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFAF3Q9BU61 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFAF3Q9BU61 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFAF3Q9BU61 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFAF3Q9BU61 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFAF3Q9BU61 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFAF3Q9BU61 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFAF3Q9BU61 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFAF3Q9BU61 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFAF3Q9BU61 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFAF3Q9BU61 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFAF3Q9BU61 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFAF3Q9BU61 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFAF3Q9BU61 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFAF3Q9BU61 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFAF3Q9BU61 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFAF3Q9BU61 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFAF3Q9BU61 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFAF3Q9BU61 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFAF3Q9BU61 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFAF3Q9BU61 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFAF3Q9BU61 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFAF3Q9BU61 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFAF3Q9BU61 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFAF3Q9BU61 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFAF3Q9BU61 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFAF3Q9BU61 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFAF3Q9BU61 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFAF3Q9BU61 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFAF3Q9BU61 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFAF3Q9BU61 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFAF3Q9BU61 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFAF3Q9BU61 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFAF3Q9BU61 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFAF3Q9BU61 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms