Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTC8

MTA3, Metastasis-associated protein MTA3, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA3Q9BTC8 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MTA3Q9BTC8 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MTA3Q9BTC8 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MTA3Q9BTC8 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MTA3Q9BTC8 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MTA3Q9BTC8 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MTA3Q9BTC8 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MTA3Q9BTC8 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
MTA3Q9BTC8 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
MTA3Q9BTC8 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MTA3Q9BTC8 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MTA3Q9BTC8 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MTA3Q9BTC8 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MTA3Q9BTC8 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MTA3Q9BTC8 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MTA3Q9BTC8 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MTA3Q9BTC8 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MTA3Q9BTC8 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MTA3Q9BTC8 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MTA3Q9BTC8 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MTA3Q9BTC8 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
MTA3Q9BTC8 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MTA3Q9BTC8 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MTA3Q9BTC8 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MTA3Q9BTC8 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
MTA3Q9BTC8 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MTA3Q9BTC8 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MTA3Q9BTC8 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MTA3Q9BTC8 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MTA3Q9BTC8 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
MTA3Q9BTC8 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MTA3Q9BTC8 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MTA3Q9BTC8 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MTA3Q9BTC8 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MTA3Q9BTC8 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MTA3Q9BTC8 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MTA3Q9BTC8 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MTA3Q9BTC8 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MTA3Q9BTC8 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
MTA3Q9BTC8 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MTA3Q9BTC8 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MTA3Q9BTC8 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MTA3Q9BTC8 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MTA3Q9BTC8 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MTA3Q9BTC8 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MTA3Q9BTC8 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MTA3Q9BTC8 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MTA3Q9BTC8 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MTA3Q9BTC8 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MTA3Q9BTC8 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
MTA3Q9BTC8 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MTA3Q9BTC8 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MTA3Q9BTC8 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MTA3Q9BTC8 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MTA3Q9BTC8 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MTA3Q9BTC8 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MTA3Q9BTC8 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
MTA3Q9BTC8 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MTA3Q9BTC8 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MTA3Q9BTC8 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MTA3Q9BTC8 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
MTA3Q9BTC8 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MTA3Q9BTC8 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MTA3Q9BTC8 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MTA3Q9BTC8 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MTA3Q9BTC8 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MTA3Q9BTC8 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MTA3Q9BTC8 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MTA3Q9BTC8 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MTA3Q9BTC8 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MTA3Q9BTC8 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MTA3Q9BTC8 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MTA3Q9BTC8 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MTA3Q9BTC8 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MTA3Q9BTC8 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MTA3Q9BTC8 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MTA3Q9BTC8 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MTA3Q9BTC8 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MTA3Q9BTC8 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MTA3Q9BTC8 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
MTA3Q9BTC8 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MTA3Q9BTC8 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MTA3Q9BTC8 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MTA3Q9BTC8 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MTA3Q9BTC8 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MTA3Q9BTC8 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MTA3Q9BTC8 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
MTA3Q9BTC8 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
MTA3Q9BTC8 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MTA3Q9BTC8 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MTA3Q9BTC8 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MTA3Q9BTC8 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MTA3Q9BTC8 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MTA3Q9BTC8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MTA3Q9BTC8 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MTA3Q9BTC8 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MTA3Q9BTC8 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MTA3Q9BTC8 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MTA3Q9BTC8 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MTA3Q9BTC8 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms