Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRA2

TXNDC17, Thioredoxin domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC17Q9BRA2 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TXNDC17Q9BRA2 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TXNDC17Q9BRA2 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TXNDC17Q9BRA2 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TXNDC17Q9BRA2 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TXNDC17Q9BRA2 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TXNDC17Q9BRA2 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TXNDC17Q9BRA2 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TXNDC17Q9BRA2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TXNDC17Q9BRA2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TXNDC17Q9BRA2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TXNDC17Q9BRA2 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TXNDC17Q9BRA2 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TXNDC17Q9BRA2 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TXNDC17Q9BRA2 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TXNDC17Q9BRA2 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TXNDC17Q9BRA2 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TXNDC17Q9BRA2 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TXNDC17Q9BRA2 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TXNDC17Q9BRA2 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TXNDC17Q9BRA2 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TXNDC17Q9BRA2 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TXNDC17Q9BRA2 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TXNDC17Q9BRA2 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TXNDC17Q9BRA2 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TXNDC17Q9BRA2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TXNDC17Q9BRA2 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TXNDC17Q9BRA2 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TXNDC17Q9BRA2 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TXNDC17Q9BRA2 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TXNDC17Q9BRA2 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TXNDC17Q9BRA2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TXNDC17Q9BRA2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TXNDC17Q9BRA2 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TXNDC17Q9BRA2 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TXNDC17Q9BRA2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TXNDC17Q9BRA2 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TXNDC17Q9BRA2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TXNDC17Q9BRA2 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TXNDC17Q9BRA2 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TXNDC17Q9BRA2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TXNDC17Q9BRA2 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TXNDC17Q9BRA2 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TXNDC17Q9BRA2 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TXNDC17Q9BRA2 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TXNDC17Q9BRA2 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TXNDC17Q9BRA2 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TXNDC17Q9BRA2 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TXNDC17Q9BRA2 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TXNDC17Q9BRA2 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TXNDC17Q9BRA2 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TXNDC17Q9BRA2 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TXNDC17Q9BRA2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TXNDC17Q9BRA2 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TXNDC17Q9BRA2 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TXNDC17Q9BRA2 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TXNDC17Q9BRA2 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TXNDC17Q9BRA2 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TXNDC17Q9BRA2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TXNDC17Q9BRA2 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TXNDC17Q9BRA2 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TXNDC17Q9BRA2 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TXNDC17Q9BRA2 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TXNDC17Q9BRA2 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TXNDC17Q9BRA2 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TXNDC17Q9BRA2 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TXNDC17Q9BRA2 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TXNDC17Q9BRA2 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TXNDC17Q9BRA2 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TXNDC17Q9BRA2 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TXNDC17Q9BRA2 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TXNDC17Q9BRA2 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TXNDC17Q9BRA2 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TXNDC17Q9BRA2 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TXNDC17Q9BRA2 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TXNDC17Q9BRA2 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TXNDC17Q9BRA2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TXNDC17Q9BRA2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TXNDC17Q9BRA2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TXNDC17Q9BRA2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TXNDC17Q9BRA2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TXNDC17Q9BRA2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TXNDC17Q9BRA2 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TXNDC17Q9BRA2 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TXNDC17Q9BRA2 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TXNDC17Q9BRA2 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TXNDC17Q9BRA2 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TXNDC17Q9BRA2 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TXNDC17Q9BRA2 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TXNDC17Q9BRA2 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TXNDC17Q9BRA2 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TXNDC17Q9BRA2 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TXNDC17Q9BRA2 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TXNDC17Q9BRA2 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TXNDC17Q9BRA2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TXNDC17Q9BRA2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TXNDC17Q9BRA2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TXNDC17Q9BRA2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TXNDC17Q9BRA2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TXNDC17Q9BRA2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms