Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR77

CCDC77, Coiled-coil domain-containing protein 77, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC77Q9BR77 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC77Q9BR77 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC77Q9BR77 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC77Q9BR77 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC77Q9BR77 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC77Q9BR77 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC77Q9BR77 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
CCDC77Q9BR77 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
CCDC77Q9BR77 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC77Q9BR77 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC77Q9BR77 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC77Q9BR77 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC77Q9BR77 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC77Q9BR77 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC77Q9BR77 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC77Q9BR77 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC77Q9BR77 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC77Q9BR77 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC77Q9BR77 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC77Q9BR77 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC77Q9BR77 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC77Q9BR77 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC77Q9BR77 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC77Q9BR77 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC77Q9BR77 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC77Q9BR77 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC77Q9BR77 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC77Q9BR77 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC77Q9BR77 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC77Q9BR77 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC77Q9BR77 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC77Q9BR77 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC77Q9BR77 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC77Q9BR77 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC77Q9BR77 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC77Q9BR77 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC77Q9BR77 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC77Q9BR77 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC77Q9BR77 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC77Q9BR77 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC77Q9BR77 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC77Q9BR77 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC77Q9BR77 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC77Q9BR77 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC77Q9BR77 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC77Q9BR77 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC77Q9BR77 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC77Q9BR77 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC77Q9BR77 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC77Q9BR77 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC77Q9BR77 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC77Q9BR77 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC77Q9BR77 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC77Q9BR77 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC77Q9BR77 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC77Q9BR77 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC77Q9BR77 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC77Q9BR77 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC77Q9BR77 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC77Q9BR77 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC77Q9BR77 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC77Q9BR77 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC77Q9BR77 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC77Q9BR77 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC77Q9BR77 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC77Q9BR77 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC77Q9BR77 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC77Q9BR77 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC77Q9BR77 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC77Q9BR77 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC77Q9BR77 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC77Q9BR77 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC77Q9BR77 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC77Q9BR77 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC77Q9BR77 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC77Q9BR77 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC77Q9BR77 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC77Q9BR77 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC77Q9BR77 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC77Q9BR77 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC77Q9BR77 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC77Q9BR77 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC77Q9BR77 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC77Q9BR77 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC77Q9BR77 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC77Q9BR77 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC77Q9BR77 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC77Q9BR77 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC77Q9BR77 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC77Q9BR77 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC77Q9BR77 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC77Q9BR77 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC77Q9BR77 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC77Q9BR77 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC77Q9BR77 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC77Q9BR77 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC77Q9BR77 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC77Q9BR77 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC77Q9BR77 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC77Q9BR77 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms