Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SGIP1Q9BQI5 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SGIP1Q9BQI5 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SGIP1Q9BQI5 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SGIP1Q9BQI5 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SGIP1Q9BQI5 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SGIP1Q9BQI5 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SGIP1Q9BQI5 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SGIP1Q9BQI5 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SGIP1Q9BQI5 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SGIP1Q9BQI5 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SGIP1Q9BQI5 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SGIP1Q9BQI5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SGIP1Q9BQI5 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SGIP1Q9BQI5 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SGIP1Q9BQI5 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SGIP1Q9BQI5 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SGIP1Q9BQI5 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SGIP1Q9BQI5 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SGIP1Q9BQI5 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SGIP1Q9BQI5 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SGIP1Q9BQI5 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SGIP1Q9BQI5 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SGIP1Q9BQI5 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SGIP1Q9BQI5 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SGIP1Q9BQI5 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SGIP1Q9BQI5 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SGIP1Q9BQI5 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SGIP1Q9BQI5 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SGIP1Q9BQI5 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SGIP1Q9BQI5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SGIP1Q9BQI5 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SGIP1Q9BQI5 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SGIP1Q9BQI5 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SGIP1Q9BQI5 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SGIP1Q9BQI5 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SGIP1Q9BQI5 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SGIP1Q9BQI5 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SGIP1Q9BQI5 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SGIP1Q9BQI5 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SGIP1Q9BQI5 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SGIP1Q9BQI5 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SGIP1Q9BQI5 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SGIP1Q9BQI5 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SGIP1Q9BQI5 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SGIP1Q9BQI5 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SGIP1Q9BQI5 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SGIP1Q9BQI5 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SGIP1Q9BQI5 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SGIP1Q9BQI5 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SGIP1Q9BQI5 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SGIP1Q9BQI5 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SGIP1Q9BQI5 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SGIP1Q9BQI5 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SGIP1Q9BQI5 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SGIP1Q9BQI5 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SGIP1Q9BQI5 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SGIP1Q9BQI5 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SGIP1Q9BQI5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SGIP1Q9BQI5 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SGIP1Q9BQI5 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SGIP1Q9BQI5 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SGIP1Q9BQI5 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SGIP1Q9BQI5 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SGIP1Q9BQI5 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SGIP1Q9BQI5 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SGIP1Q9BQI5 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SGIP1Q9BQI5 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SGIP1Q9BQI5 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SGIP1Q9BQI5 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SGIP1Q9BQI5 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SGIP1Q9BQI5 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SGIP1Q9BQI5 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SGIP1Q9BQI5 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SGIP1Q9BQI5 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SGIP1Q9BQI5 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SGIP1Q9BQI5 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SGIP1Q9BQI5 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SGIP1Q9BQI5 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SGIP1Q9BQI5 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SGIP1Q9BQI5 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SGIP1Q9BQI5 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SGIP1Q9BQI5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SGIP1Q9BQI5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SGIP1Q9BQI5 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SGIP1Q9BQI5 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SGIP1Q9BQI5 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SGIP1Q9BQI5 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SGIP1Q9BQI5 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SGIP1Q9BQI5 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SGIP1Q9BQI5 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SGIP1Q9BQI5 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SGIP1Q9BQI5 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SGIP1Q9BQI5 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SGIP1Q9BQI5 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SGIP1Q9BQI5 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SGIP1Q9BQI5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SGIP1Q9BQI5 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SGIP1Q9BQI5 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SGIP1Q9BQI5 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82 ms