Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TREX2Q9BQ50 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TREX2Q9BQ50 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TREX2Q9BQ50 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TREX2Q9BQ50 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TREX2Q9BQ50 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TREX2Q9BQ50 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TREX2Q9BQ50 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TREX2Q9BQ50 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TREX2Q9BQ50 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TREX2Q9BQ50 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TREX2Q9BQ50 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TREX2Q9BQ50 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TREX2Q9BQ50 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TREX2Q9BQ50 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TREX2Q9BQ50 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TREX2Q9BQ50 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TREX2Q9BQ50 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TREX2Q9BQ50 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TREX2Q9BQ50 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TREX2Q9BQ50 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TREX2Q9BQ50 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TREX2Q9BQ50 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TREX2Q9BQ50 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TREX2Q9BQ50 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TREX2Q9BQ50 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TREX2Q9BQ50 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TREX2Q9BQ50 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TREX2Q9BQ50 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TREX2Q9BQ50 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TREX2Q9BQ50 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TREX2Q9BQ50 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TREX2Q9BQ50 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TREX2Q9BQ50 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TREX2Q9BQ50 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TREX2Q9BQ50 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TREX2Q9BQ50 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TREX2Q9BQ50 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TREX2Q9BQ50 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TREX2Q9BQ50 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TREX2Q9BQ50 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TREX2Q9BQ50 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TREX2Q9BQ50 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TREX2Q9BQ50 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TREX2Q9BQ50 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TREX2Q9BQ50 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TREX2Q9BQ50 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TREX2Q9BQ50 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TREX2Q9BQ50 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TREX2Q9BQ50 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TREX2Q9BQ50 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TREX2Q9BQ50 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TREX2Q9BQ50 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TREX2Q9BQ50 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TREX2Q9BQ50 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TREX2Q9BQ50 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TREX2Q9BQ50 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
TREX2Q9BQ50 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TREX2Q9BQ50 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TREX2Q9BQ50 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TREX2Q9BQ50 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TREX2Q9BQ50 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TREX2Q9BQ50 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TREX2Q9BQ50 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TREX2Q9BQ50 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TREX2Q9BQ50 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TREX2Q9BQ50 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TREX2Q9BQ50 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TREX2Q9BQ50 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TREX2Q9BQ50 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TREX2Q9BQ50 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TREX2Q9BQ50 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TREX2Q9BQ50 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TREX2Q9BQ50 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TREX2Q9BQ50 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TREX2Q9BQ50 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TREX2Q9BQ50 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TREX2Q9BQ50 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TREX2Q9BQ50 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TREX2Q9BQ50 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TREX2Q9BQ50 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TREX2Q9BQ50 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TREX2Q9BQ50 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TREX2Q9BQ50 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TREX2Q9BQ50 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TREX2Q9BQ50 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TREX2Q9BQ50 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TREX2Q9BQ50 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TREX2Q9BQ50 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TREX2Q9BQ50 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TREX2Q9BQ50 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TREX2Q9BQ50 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TREX2Q9BQ50 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TREX2Q9BQ50 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TREX2Q9BQ50 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TREX2Q9BQ50 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TREX2Q9BQ50 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TREX2Q9BQ50 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TREX2Q9BQ50 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TREX2Q9BQ50 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms