Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ49

SMIM7, Small integral membrane protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM7Q9BQ49 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM7Q9BQ49 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM7Q9BQ49 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM7Q9BQ49 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM7Q9BQ49 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM7Q9BQ49 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM7Q9BQ49 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM7Q9BQ49 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM7Q9BQ49 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM7Q9BQ49 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM7Q9BQ49 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM7Q9BQ49 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMIM7Q9BQ49 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMIM7Q9BQ49 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMIM7Q9BQ49 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMIM7Q9BQ49 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMIM7Q9BQ49 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMIM7Q9BQ49 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMIM7Q9BQ49 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMIM7Q9BQ49 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMIM7Q9BQ49 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMIM7Q9BQ49 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMIM7Q9BQ49 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMIM7Q9BQ49 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMIM7Q9BQ49 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMIM7Q9BQ49 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMIM7Q9BQ49 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMIM7Q9BQ49 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMIM7Q9BQ49 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMIM7Q9BQ49 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMIM7Q9BQ49 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMIM7Q9BQ49 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMIM7Q9BQ49 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SMIM7Q9BQ49 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SMIM7Q9BQ49 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SMIM7Q9BQ49 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SMIM7Q9BQ49 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SMIM7Q9BQ49 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SMIM7Q9BQ49 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM7Q9BQ49 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM7Q9BQ49 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM7Q9BQ49 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM7Q9BQ49 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM7Q9BQ49 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM7Q9BQ49 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM7Q9BQ49 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM7Q9BQ49 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM7Q9BQ49 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM7Q9BQ49 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM7Q9BQ49 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM7Q9BQ49 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM7Q9BQ49 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM7Q9BQ49 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM7Q9BQ49 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM7Q9BQ49 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM7Q9BQ49 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM7Q9BQ49 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM7Q9BQ49 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM7Q9BQ49 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM7Q9BQ49 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM7Q9BQ49 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM7Q9BQ49 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM7Q9BQ49 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM7Q9BQ49 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM7Q9BQ49 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM7Q9BQ49 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM7Q9BQ49 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM7Q9BQ49 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM7Q9BQ49 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM7Q9BQ49 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM7Q9BQ49 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM7Q9BQ49 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM7Q9BQ49 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM7Q9BQ49 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM7Q9BQ49 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM7Q9BQ49 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM7Q9BQ49 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM7Q9BQ49 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM7Q9BQ49 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM7Q9BQ49 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM7Q9BQ49 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM7Q9BQ49 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM7Q9BQ49 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM7Q9BQ49 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM7Q9BQ49 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMIM7Q9BQ49 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMIM7Q9BQ49 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMIM7Q9BQ49 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMIM7Q9BQ49 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMIM7Q9BQ49 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMIM7Q9BQ49 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMIM7Q9BQ49 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMIM7Q9BQ49 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SMIM7Q9BQ49 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SMIM7Q9BQ49 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMIM7Q9BQ49 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMIM7Q9BQ49 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMIM7Q9BQ49 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMIM7Q9BQ49 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMIM7Q9BQ49 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms