Protein–RNA interactions for Protein: Q99613

EIF3C, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3CQ99613 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EIF3CQ99613 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EIF3CQ99613 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EIF3CQ99613 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EIF3CQ99613 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EIF3CQ99613 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
EIF3CQ99613 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EIF3CQ99613 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EIF3CQ99613 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
EIF3CQ99613 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
EIF3CQ99613 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EIF3CQ99613 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EIF3CQ99613 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EIF3CQ99613 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EIF3CQ99613 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EIF3CQ99613 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EIF3CQ99613 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EIF3CQ99613 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EIF3CQ99613 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EIF3CQ99613 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EIF3CQ99613 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EIF3CQ99613 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EIF3CQ99613 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EIF3CQ99613 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EIF3CQ99613 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EIF3CQ99613 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EIF3CQ99613 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EIF3CQ99613 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EIF3CQ99613 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EIF3CQ99613 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EIF3CQ99613 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EIF3CQ99613 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EIF3CQ99613 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EIF3CQ99613 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EIF3CQ99613 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EIF3CQ99613 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EIF3CQ99613 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EIF3CQ99613 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EIF3CQ99613 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EIF3CQ99613 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EIF3CQ99613 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EIF3CQ99613 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EIF3CQ99613 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EIF3CQ99613 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
EIF3CQ99613 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EIF3CQ99613 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
EIF3CQ99613 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EIF3CQ99613 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EIF3CQ99613 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EIF3CQ99613 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EIF3CQ99613 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EIF3CQ99613 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EIF3CQ99613 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EIF3CQ99613 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EIF3CQ99613 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EIF3CQ99613 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EIF3CQ99613 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EIF3CQ99613 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EIF3CQ99613 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EIF3CQ99613 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EIF3CQ99613 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EIF3CQ99613 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
EIF3CQ99613 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EIF3CQ99613 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EIF3CQ99613 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EIF3CQ99613 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EIF3CQ99613 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EIF3CQ99613 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EIF3CQ99613 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EIF3CQ99613 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EIF3CQ99613 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EIF3CQ99613 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EIF3CQ99613 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EIF3CQ99613 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EIF3CQ99613 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EIF3CQ99613 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EIF3CQ99613 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EIF3CQ99613 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EIF3CQ99613 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
EIF3CQ99613 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EIF3CQ99613 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EIF3CQ99613 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
EIF3CQ99613 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EIF3CQ99613 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EIF3CQ99613 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EIF3CQ99613 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EIF3CQ99613 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EIF3CQ99613 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EIF3CQ99613 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EIF3CQ99613 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EIF3CQ99613 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EIF3CQ99613 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EIF3CQ99613 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
EIF3CQ99613 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EIF3CQ99613 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EIF3CQ99613 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
EIF3CQ99613 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EIF3CQ99613 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EIF3CQ99613 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EIF3CQ99613 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms