Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
VAT1Q99536 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VAT1Q99536 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VAT1Q99536 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VAT1Q99536 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
VAT1Q99536 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
VAT1Q99536 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
VAT1Q99536 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
VAT1Q99536 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VAT1Q99536 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
VAT1Q99536 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
VAT1Q99536 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VAT1Q99536 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
VAT1Q99536 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VAT1Q99536 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VAT1Q99536 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VAT1Q99536 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
VAT1Q99536 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VAT1Q99536 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
VAT1Q99536 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VAT1Q99536 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VAT1Q99536 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VAT1Q99536 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
VAT1Q99536 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VAT1Q99536 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
VAT1Q99536 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VAT1Q99536 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VAT1Q99536 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VAT1Q99536 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VAT1Q99536 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VAT1Q99536 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VAT1Q99536 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VAT1Q99536 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VAT1Q99536 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VAT1Q99536 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VAT1Q99536 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VAT1Q99536 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VAT1Q99536 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VAT1Q99536 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VAT1Q99536 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VAT1Q99536 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VAT1Q99536 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VAT1Q99536 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VAT1Q99536 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VAT1Q99536 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
VAT1Q99536 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VAT1Q99536 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VAT1Q99536 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VAT1Q99536 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VAT1Q99536 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VAT1Q99536 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VAT1Q99536 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VAT1Q99536 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VAT1Q99536 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VAT1Q99536 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VAT1Q99536 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VAT1Q99536 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VAT1Q99536 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VAT1Q99536 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VAT1Q99536 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VAT1Q99536 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VAT1Q99536 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VAT1Q99536 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VAT1Q99536 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VAT1Q99536 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VAT1Q99536 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
VAT1Q99536 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VAT1Q99536 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VAT1Q99536 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VAT1Q99536 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VAT1Q99536 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VAT1Q99536 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VAT1Q99536 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VAT1Q99536 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VAT1Q99536 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VAT1Q99536 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VAT1Q99536 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
VAT1Q99536 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VAT1Q99536 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VAT1Q99536 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VAT1Q99536 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
VAT1Q99536 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VAT1Q99536 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
VAT1Q99536 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VAT1Q99536 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VAT1Q99536 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VAT1Q99536 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
VAT1Q99536 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VAT1Q99536 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VAT1Q99536 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
VAT1Q99536 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VAT1Q99536 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VAT1Q99536 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VAT1Q99536 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VAT1Q99536 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VAT1Q99536 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VAT1Q99536 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VAT1Q99536 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VAT1Q99536 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VAT1Q99536 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms