Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV0

SYNGAP1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGAP1Q96PV0 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYNGAP1Q96PV0 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYNGAP1Q96PV0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYNGAP1Q96PV0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYNGAP1Q96PV0 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SYNGAP1Q96PV0 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYNGAP1Q96PV0 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SYNGAP1Q96PV0 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYNGAP1Q96PV0 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYNGAP1Q96PV0 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYNGAP1Q96PV0 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SYNGAP1Q96PV0 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYNGAP1Q96PV0 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYNGAP1Q96PV0 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYNGAP1Q96PV0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYNGAP1Q96PV0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYNGAP1Q96PV0 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYNGAP1Q96PV0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYNGAP1Q96PV0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYNGAP1Q96PV0 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYNGAP1Q96PV0 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYNGAP1Q96PV0 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SYNGAP1Q96PV0 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYNGAP1Q96PV0 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SYNGAP1Q96PV0 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYNGAP1Q96PV0 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYNGAP1Q96PV0 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYNGAP1Q96PV0 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYNGAP1Q96PV0 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYNGAP1Q96PV0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYNGAP1Q96PV0 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYNGAP1Q96PV0 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYNGAP1Q96PV0 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYNGAP1Q96PV0 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYNGAP1Q96PV0 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SYNGAP1Q96PV0 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYNGAP1Q96PV0 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYNGAP1Q96PV0 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYNGAP1Q96PV0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYNGAP1Q96PV0 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYNGAP1Q96PV0 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYNGAP1Q96PV0 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYNGAP1Q96PV0 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYNGAP1Q96PV0 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SYNGAP1Q96PV0 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYNGAP1Q96PV0 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYNGAP1Q96PV0 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SYNGAP1Q96PV0 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYNGAP1Q96PV0 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYNGAP1Q96PV0 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYNGAP1Q96PV0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYNGAP1Q96PV0 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYNGAP1Q96PV0 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYNGAP1Q96PV0 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYNGAP1Q96PV0 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYNGAP1Q96PV0 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYNGAP1Q96PV0 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYNGAP1Q96PV0 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYNGAP1Q96PV0 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYNGAP1Q96PV0 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYNGAP1Q96PV0 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYNGAP1Q96PV0 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYNGAP1Q96PV0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYNGAP1Q96PV0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYNGAP1Q96PV0 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
SYNGAP1Q96PV0 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SYNGAP1Q96PV0 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SYNGAP1Q96PV0 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SYNGAP1Q96PV0 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SYNGAP1Q96PV0 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SYNGAP1Q96PV0 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SYNGAP1Q96PV0 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SYNGAP1Q96PV0 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
SYNGAP1Q96PV0 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SYNGAP1Q96PV0 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYNGAP1Q96PV0 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYNGAP1Q96PV0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYNGAP1Q96PV0 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYNGAP1Q96PV0 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYNGAP1Q96PV0 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYNGAP1Q96PV0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYNGAP1Q96PV0 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYNGAP1Q96PV0 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYNGAP1Q96PV0 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYNGAP1Q96PV0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYNGAP1Q96PV0 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYNGAP1Q96PV0 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SYNGAP1Q96PV0 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYNGAP1Q96PV0 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYNGAP1Q96PV0 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYNGAP1Q96PV0 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYNGAP1Q96PV0 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYNGAP1Q96PV0 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYNGAP1Q96PV0 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYNGAP1Q96PV0 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYNGAP1Q96PV0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYNGAP1Q96PV0 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYNGAP1Q96PV0 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYNGAP1Q96PV0 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYNGAP1Q96PV0 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms