Protein–RNA interactions for Protein: Q96NG5

ZNF558, Zinc finger protein 558, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF558Q96NG5 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF558Q96NG5 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF558Q96NG5 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF558Q96NG5 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF558Q96NG5 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF558Q96NG5 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF558Q96NG5 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF558Q96NG5 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF558Q96NG5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF558Q96NG5 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF558Q96NG5 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF558Q96NG5 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF558Q96NG5 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF558Q96NG5 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF558Q96NG5 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF558Q96NG5 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF558Q96NG5 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF558Q96NG5 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF558Q96NG5 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF558Q96NG5 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF558Q96NG5 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF558Q96NG5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF558Q96NG5 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF558Q96NG5 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF558Q96NG5 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF558Q96NG5 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF558Q96NG5 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF558Q96NG5 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF558Q96NG5 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF558Q96NG5 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF558Q96NG5 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF558Q96NG5 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF558Q96NG5 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF558Q96NG5 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF558Q96NG5 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF558Q96NG5 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF558Q96NG5 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF558Q96NG5 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF558Q96NG5 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF558Q96NG5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF558Q96NG5 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF558Q96NG5 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF558Q96NG5 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF558Q96NG5 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF558Q96NG5 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF558Q96NG5 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF558Q96NG5 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF558Q96NG5 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF558Q96NG5 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF558Q96NG5 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF558Q96NG5 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF558Q96NG5 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF558Q96NG5 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF558Q96NG5 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF558Q96NG5 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF558Q96NG5 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF558Q96NG5 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF558Q96NG5 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF558Q96NG5 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF558Q96NG5 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF558Q96NG5 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF558Q96NG5 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF558Q96NG5 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF558Q96NG5 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF558Q96NG5 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF558Q96NG5 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF558Q96NG5 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF558Q96NG5 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF558Q96NG5 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF558Q96NG5 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF558Q96NG5 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF558Q96NG5 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF558Q96NG5 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF558Q96NG5 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF558Q96NG5 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF558Q96NG5 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF558Q96NG5 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF558Q96NG5 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF558Q96NG5 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF558Q96NG5 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF558Q96NG5 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF558Q96NG5 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF558Q96NG5 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF558Q96NG5 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF558Q96NG5 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF558Q96NG5 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF558Q96NG5 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF558Q96NG5 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF558Q96NG5 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF558Q96NG5 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF558Q96NG5 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF558Q96NG5 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF558Q96NG5 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF558Q96NG5 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF558Q96NG5 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF558Q96NG5 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF558Q96NG5 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF558Q96NG5 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF558Q96NG5 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF558Q96NG5 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms