Protein–RNA interactions for Protein: Q96MN9

ZNF488, Zinc finger protein 488, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF488Q96MN9 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ZNF488Q96MN9 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ZNF488Q96MN9 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ZNF488Q96MN9 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ZNF488Q96MN9 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ZNF488Q96MN9 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ZNF488Q96MN9 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ZNF488Q96MN9 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ZNF488Q96MN9 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ZNF488Q96MN9 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ZNF488Q96MN9 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
ZNF488Q96MN9 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ZNF488Q96MN9 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ZNF488Q96MN9 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ZNF488Q96MN9 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ZNF488Q96MN9 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ZNF488Q96MN9 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ZNF488Q96MN9 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNF488Q96MN9 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNF488Q96MN9 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNF488Q96MN9 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNF488Q96MN9 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNF488Q96MN9 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNF488Q96MN9 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNF488Q96MN9 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNF488Q96MN9 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNF488Q96MN9 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNF488Q96MN9 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNF488Q96MN9 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNF488Q96MN9 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNF488Q96MN9 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNF488Q96MN9 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNF488Q96MN9 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNF488Q96MN9 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNF488Q96MN9 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNF488Q96MN9 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNF488Q96MN9 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNF488Q96MN9 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNF488Q96MN9 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNF488Q96MN9 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNF488Q96MN9 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNF488Q96MN9 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF488Q96MN9 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF488Q96MN9 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF488Q96MN9 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF488Q96MN9 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF488Q96MN9 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF488Q96MN9 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF488Q96MN9 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF488Q96MN9 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF488Q96MN9 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF488Q96MN9 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF488Q96MN9 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF488Q96MN9 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF488Q96MN9 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF488Q96MN9 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF488Q96MN9 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF488Q96MN9 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF488Q96MN9 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF488Q96MN9 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF488Q96MN9 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF488Q96MN9 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF488Q96MN9 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF488Q96MN9 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF488Q96MN9 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF488Q96MN9 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF488Q96MN9 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF488Q96MN9 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF488Q96MN9 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF488Q96MN9 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF488Q96MN9 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF488Q96MN9 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF488Q96MN9 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF488Q96MN9 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF488Q96MN9 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF488Q96MN9 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF488Q96MN9 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF488Q96MN9 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF488Q96MN9 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF488Q96MN9 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF488Q96MN9 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF488Q96MN9 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF488Q96MN9 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF488Q96MN9 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF488Q96MN9 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF488Q96MN9 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF488Q96MN9 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF488Q96MN9 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF488Q96MN9 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF488Q96MN9 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF488Q96MN9 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF488Q96MN9 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF488Q96MN9 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF488Q96MN9 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF488Q96MN9 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF488Q96MN9 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF488Q96MN9 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF488Q96MN9 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF488Q96MN9 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF488Q96MN9 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms