Protein–RNA interactions for Protein: Q96L91

EP400, E1A-binding protein p400, humanhuman

Predictions only

Length 3,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP400Q96L91 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
EP400Q96L91 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
EP400Q96L91 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
EP400Q96L91 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
EP400Q96L91 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
EP400Q96L91 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
EP400Q96L91 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
EP400Q96L91 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
EP400Q96L91 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
EP400Q96L91 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
EP400Q96L91 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
EP400Q96L91 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
EP400Q96L91 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
EP400Q96L91 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
EP400Q96L91 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
EP400Q96L91 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
EP400Q96L91 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
EP400Q96L91 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
EP400Q96L91 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
EP400Q96L91 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
EP400Q96L91 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
EP400Q96L91 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
EP400Q96L91 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
EP400Q96L91 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
EP400Q96L91 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
EP400Q96L91 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
EP400Q96L91 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
EP400Q96L91 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
EP400Q96L91 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
EP400Q96L91 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
EP400Q96L91 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
EP400Q96L91 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
EP400Q96L91 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
EP400Q96L91 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
EP400Q96L91 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
EP400Q96L91 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
EP400Q96L91 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
EP400Q96L91 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
EP400Q96L91 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
EP400Q96L91 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
EP400Q96L91 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
EP400Q96L91 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
EP400Q96L91 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
EP400Q96L91 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
EP400Q96L91 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
EP400Q96L91 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
EP400Q96L91 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
EP400Q96L91 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
EP400Q96L91 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
EP400Q96L91 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
EP400Q96L91 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
EP400Q96L91 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
EP400Q96L91 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
EP400Q96L91 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
EP400Q96L91 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
EP400Q96L91 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
EP400Q96L91 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
EP400Q96L91 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
EP400Q96L91 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
EP400Q96L91 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
EP400Q96L91 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
EP400Q96L91 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
EP400Q96L91 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
EP400Q96L91 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
EP400Q96L91 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
EP400Q96L91 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
EP400Q96L91 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
EP400Q96L91 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
EP400Q96L91 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
EP400Q96L91 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
EP400Q96L91 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
EP400Q96L91 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
EP400Q96L91 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
EP400Q96L91 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
EP400Q96L91 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
EP400Q96L91 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
EP400Q96L91 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
EP400Q96L91 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
EP400Q96L91 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
EP400Q96L91 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
EP400Q96L91 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
EP400Q96L91 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
EP400Q96L91 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
EP400Q96L91 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
EP400Q96L91 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
EP400Q96L91 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
EP400Q96L91 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
EP400Q96L91 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
EP400Q96L91 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
EP400Q96L91 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
EP400Q96L91 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
EP400Q96L91 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
EP400Q96L91 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
EP400Q96L91 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
EP400Q96L91 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
EP400Q96L91 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
EP400Q96L91 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
EP400Q96L91 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
EP400Q96L91 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
EP400Q96L91 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms