Protein–RNA interactions for Protein: Q96JX3

SERAC1, Protein SERAC1, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERAC1Q96JX3 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SERAC1Q96JX3 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SERAC1Q96JX3 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SERAC1Q96JX3 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SERAC1Q96JX3 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SERAC1Q96JX3 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SERAC1Q96JX3 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SERAC1Q96JX3 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SERAC1Q96JX3 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SERAC1Q96JX3 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SERAC1Q96JX3 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SERAC1Q96JX3 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SERAC1Q96JX3 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SERAC1Q96JX3 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SERAC1Q96JX3 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SERAC1Q96JX3 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SERAC1Q96JX3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SERAC1Q96JX3 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SERAC1Q96JX3 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SERAC1Q96JX3 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SERAC1Q96JX3 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SERAC1Q96JX3 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SERAC1Q96JX3 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SERAC1Q96JX3 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SERAC1Q96JX3 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SERAC1Q96JX3 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SERAC1Q96JX3 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SERAC1Q96JX3 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SERAC1Q96JX3 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SERAC1Q96JX3 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SERAC1Q96JX3 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SERAC1Q96JX3 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SERAC1Q96JX3 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SERAC1Q96JX3 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SERAC1Q96JX3 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SERAC1Q96JX3 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SERAC1Q96JX3 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SERAC1Q96JX3 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SERAC1Q96JX3 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SERAC1Q96JX3 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SERAC1Q96JX3 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SERAC1Q96JX3 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SERAC1Q96JX3 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SERAC1Q96JX3 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SERAC1Q96JX3 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SERAC1Q96JX3 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SERAC1Q96JX3 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SERAC1Q96JX3 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SERAC1Q96JX3 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SERAC1Q96JX3 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SERAC1Q96JX3 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SERAC1Q96JX3 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SERAC1Q96JX3 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SERAC1Q96JX3 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SERAC1Q96JX3 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SERAC1Q96JX3 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SERAC1Q96JX3 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SERAC1Q96JX3 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SERAC1Q96JX3 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SERAC1Q96JX3 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SERAC1Q96JX3 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SERAC1Q96JX3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SERAC1Q96JX3 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SERAC1Q96JX3 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SERAC1Q96JX3 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SERAC1Q96JX3 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SERAC1Q96JX3 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SERAC1Q96JX3 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SERAC1Q96JX3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SERAC1Q96JX3 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SERAC1Q96JX3 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SERAC1Q96JX3 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SERAC1Q96JX3 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SERAC1Q96JX3 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SERAC1Q96JX3 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SERAC1Q96JX3 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SERAC1Q96JX3 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SERAC1Q96JX3 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SERAC1Q96JX3 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SERAC1Q96JX3 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SERAC1Q96JX3 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SERAC1Q96JX3 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SERAC1Q96JX3 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SERAC1Q96JX3 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SERAC1Q96JX3 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SERAC1Q96JX3 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SERAC1Q96JX3 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SERAC1Q96JX3 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SERAC1Q96JX3 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SERAC1Q96JX3 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SERAC1Q96JX3 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SERAC1Q96JX3 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SERAC1Q96JX3 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SERAC1Q96JX3 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SERAC1Q96JX3 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SERAC1Q96JX3 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SERAC1Q96JX3 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SERAC1Q96JX3 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SERAC1Q96JX3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SERAC1Q96JX3 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms