Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC97Q96F63 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC97Q96F63 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC97Q96F63 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC97Q96F63 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC97Q96F63 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC97Q96F63 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC97Q96F63 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC97Q96F63 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC97Q96F63 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC97Q96F63 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC97Q96F63 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC97Q96F63 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC97Q96F63 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC97Q96F63 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC97Q96F63 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC97Q96F63 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC97Q96F63 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC97Q96F63 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC97Q96F63 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC97Q96F63 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC97Q96F63 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC97Q96F63 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC97Q96F63 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC97Q96F63 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC97Q96F63 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC97Q96F63 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC97Q96F63 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC97Q96F63 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC97Q96F63 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC97Q96F63 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC97Q96F63 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC97Q96F63 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC97Q96F63 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC97Q96F63 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC97Q96F63 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC97Q96F63 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC97Q96F63 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC97Q96F63 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC97Q96F63 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC97Q96F63 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC97Q96F63 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC97Q96F63 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC97Q96F63 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC97Q96F63 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC97Q96F63 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC97Q96F63 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC97Q96F63 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC97Q96F63 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC97Q96F63 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC97Q96F63 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC97Q96F63 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC97Q96F63 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC97Q96F63 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC97Q96F63 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC97Q96F63 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC97Q96F63 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC97Q96F63 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC97Q96F63 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC97Q96F63 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC97Q96F63 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC97Q96F63 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC97Q96F63 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC97Q96F63 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC97Q96F63 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC97Q96F63 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC97Q96F63 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC97Q96F63 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC97Q96F63 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC97Q96F63 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC97Q96F63 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC97Q96F63 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC97Q96F63 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC97Q96F63 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC97Q96F63 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC97Q96F63 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC97Q96F63 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC97Q96F63 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC97Q96F63 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC97Q96F63 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC97Q96F63 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC97Q96F63 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC97Q96F63 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC97Q96F63 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC97Q96F63 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC97Q96F63 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC97Q96F63 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC97Q96F63 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC97Q96F63 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC97Q96F63 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC97Q96F63 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC97Q96F63 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC97Q96F63 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC97Q96F63 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC97Q96F63 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC97Q96F63 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC97Q96F63 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC97Q96F63 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC97Q96F63 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC97Q96F63 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms